Protein–RNA interactions for Protein: Q3UU56

Gm29609, Predicted gene 29609, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm29609Q3UU56 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm29609Q3UU56 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm29609Q3UU56 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm29609Q3UU56 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm29609Q3UU56 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm29609Q3UU56 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm29609Q3UU56 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm29609Q3UU56 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm29609Q3UU56 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm29609Q3UU56 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm29609Q3UU56 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm29609Q3UU56 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm29609Q3UU56 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm29609Q3UU56 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm29609Q3UU56 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm29609Q3UU56 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm29609Q3UU56 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm29609Q3UU56 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm29609Q3UU56 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm29609Q3UU56 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm29609Q3UU56 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm29609Q3UU56 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm29609Q3UU56 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm29609Q3UU56 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm29609Q3UU56 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm29609Q3UU56 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm29609Q3UU56 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm29609Q3UU56 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm29609Q3UU56 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm29609Q3UU56 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm29609Q3UU56 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm29609Q3UU56 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm29609Q3UU56 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm29609Q3UU56 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm29609Q3UU56 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm29609Q3UU56 Mrps34-201ENSMUST00000043907 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm29609Q3UU56 Sst-201ENSMUST00000004480 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm29609Q3UU56 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm29609Q3UU56 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm29609Q3UU56 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm29609Q3UU56 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm29609Q3UU56 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm29609Q3UU56 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm29609Q3UU56 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm29609Q3UU56 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm29609Q3UU56 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm29609Q3UU56 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm29609Q3UU56 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm29609Q3UU56 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm29609Q3UU56 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm29609Q3UU56 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm29609Q3UU56 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm29609Q3UU56 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm29609Q3UU56 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm29609Q3UU56 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm29609Q3UU56 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm29609Q3UU56 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm29609Q3UU56 Ndufs5-203ENSMUST00000106207 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm29609Q3UU56 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm29609Q3UU56 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm29609Q3UU56 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm29609Q3UU56 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm29609Q3UU56 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm29609Q3UU56 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm29609Q3UU56 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm29609Q3UU56 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm29609Q3UU56 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm29609Q3UU56 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm29609Q3UU56 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm29609Q3UU56 Ndufs5-201ENSMUST00000030401 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm29609Q3UU56 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm29609Q3UU56 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm29609Q3UU56 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm29609Q3UU56 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm29609Q3UU56 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm29609Q3UU56 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm29609Q3UU56 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm29609Q3UU56 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm29609Q3UU56 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm29609Q3UU56 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm29609Q3UU56 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm29609Q3UU56 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm29609Q3UU56 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm29609Q3UU56 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm29609Q3UU56 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm29609Q3UU56 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm29609Q3UU56 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm29609Q3UU56 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm29609Q3UU56 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm29609Q3UU56 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm29609Q3UU56 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm29609Q3UU56 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm29609Q3UU56 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm29609Q3UU56 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm29609Q3UU56 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm29609Q3UU56 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm29609Q3UU56 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm29609Q3UU56 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm29609Q3UU56 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm29609Q3UU56 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.7 ms