Protein–RNA interactions for Protein: Q3URE1

Acsf3, Acyl-CoA synthetase family member 3, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acsf3Q3URE1 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Acsf3Q3URE1 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Acsf3Q3URE1 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Acsf3Q3URE1 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Acsf3Q3URE1 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Acsf3Q3URE1 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Acsf3Q3URE1 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Acsf3Q3URE1 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Acsf3Q3URE1 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Acsf3Q3URE1 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Acsf3Q3URE1 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Acsf3Q3URE1 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Acsf3Q3URE1 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Acsf3Q3URE1 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Acsf3Q3URE1 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Acsf3Q3URE1 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Acsf3Q3URE1 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Acsf3Q3URE1 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Acsf3Q3URE1 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Acsf3Q3URE1 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Acsf3Q3URE1 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Acsf3Q3URE1 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Acsf3Q3URE1 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Acsf3Q3URE1 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Acsf3Q3URE1 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Acsf3Q3URE1 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Acsf3Q3URE1 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Acsf3Q3URE1 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Acsf3Q3URE1 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Acsf3Q3URE1 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Acsf3Q3URE1 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Acsf3Q3URE1 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Acsf3Q3URE1 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Acsf3Q3URE1 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Acsf3Q3URE1 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Acsf3Q3URE1 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Acsf3Q3URE1 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Acsf3Q3URE1 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Acsf3Q3URE1 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Acsf3Q3URE1 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Acsf3Q3URE1 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Acsf3Q3URE1 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Acsf3Q3URE1 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Acsf3Q3URE1 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Acsf3Q3URE1 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Acsf3Q3URE1 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Acsf3Q3URE1 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Acsf3Q3URE1 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Acsf3Q3URE1 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Acsf3Q3URE1 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Acsf3Q3URE1 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Acsf3Q3URE1 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Acsf3Q3URE1 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Acsf3Q3URE1 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Acsf3Q3URE1 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Acsf3Q3URE1 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Acsf3Q3URE1 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Acsf3Q3URE1 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Acsf3Q3URE1 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Acsf3Q3URE1 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Acsf3Q3URE1 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Acsf3Q3URE1 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Acsf3Q3URE1 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Acsf3Q3URE1 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Acsf3Q3URE1 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Acsf3Q3URE1 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Acsf3Q3URE1 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Acsf3Q3URE1 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Acsf3Q3URE1 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Acsf3Q3URE1 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Acsf3Q3URE1 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Acsf3Q3URE1 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Acsf3Q3URE1 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Acsf3Q3URE1 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Acsf3Q3URE1 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Acsf3Q3URE1 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Acsf3Q3URE1 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Acsf3Q3URE1 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Acsf3Q3URE1 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Acsf3Q3URE1 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Acsf3Q3URE1 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Acsf3Q3URE1 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Acsf3Q3URE1 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Acsf3Q3URE1 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Acsf3Q3URE1 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Acsf3Q3URE1 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Acsf3Q3URE1 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Acsf3Q3URE1 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Acsf3Q3URE1 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Acsf3Q3URE1 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Acsf3Q3URE1 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Acsf3Q3URE1 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Acsf3Q3URE1 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Acsf3Q3URE1 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Acsf3Q3URE1 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Acsf3Q3URE1 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Acsf3Q3URE1 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Acsf3Q3URE1 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Acsf3Q3URE1 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Acsf3Q3URE1 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms