Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPL0

Sec31a, Protein transport protein Sec31A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec31aQ3UPL0 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sec31aQ3UPL0 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sec31aQ3UPL0 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sec31aQ3UPL0 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sec31aQ3UPL0 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sec31aQ3UPL0 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sec31aQ3UPL0 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sec31aQ3UPL0 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sec31aQ3UPL0 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sec31aQ3UPL0 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sec31aQ3UPL0 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sec31aQ3UPL0 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sec31aQ3UPL0 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sec31aQ3UPL0 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sec31aQ3UPL0 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sec31aQ3UPL0 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sec31aQ3UPL0 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Sec31aQ3UPL0 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sec31aQ3UPL0 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sec31aQ3UPL0 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sec31aQ3UPL0 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sec31aQ3UPL0 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sec31aQ3UPL0 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sec31aQ3UPL0 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sec31aQ3UPL0 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Sec31aQ3UPL0 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sec31aQ3UPL0 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Sec31aQ3UPL0 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sec31aQ3UPL0 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Sec31aQ3UPL0 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sec31aQ3UPL0 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sec31aQ3UPL0 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sec31aQ3UPL0 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sec31aQ3UPL0 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sec31aQ3UPL0 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sec31aQ3UPL0 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sec31aQ3UPL0 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sec31aQ3UPL0 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sec31aQ3UPL0 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sec31aQ3UPL0 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sec31aQ3UPL0 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sec31aQ3UPL0 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sec31aQ3UPL0 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sec31aQ3UPL0 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sec31aQ3UPL0 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sec31aQ3UPL0 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sec31aQ3UPL0 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sec31aQ3UPL0 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sec31aQ3UPL0 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sec31aQ3UPL0 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sec31aQ3UPL0 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Sec31aQ3UPL0 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sec31aQ3UPL0 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Sec31aQ3UPL0 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sec31aQ3UPL0 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sec31aQ3UPL0 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sec31aQ3UPL0 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sec31aQ3UPL0 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sec31aQ3UPL0 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sec31aQ3UPL0 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sec31aQ3UPL0 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sec31aQ3UPL0 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sec31aQ3UPL0 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sec31aQ3UPL0 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Sec31aQ3UPL0 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Sec31aQ3UPL0 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Sec31aQ3UPL0 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Sec31aQ3UPL0 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Sec31aQ3UPL0 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Sec31aQ3UPL0 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Sec31aQ3UPL0 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Sec31aQ3UPL0 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Sec31aQ3UPL0 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Sec31aQ3UPL0 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sec31aQ3UPL0 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sec31aQ3UPL0 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sec31aQ3UPL0 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Sec31aQ3UPL0 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Sec31aQ3UPL0 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sec31aQ3UPL0 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sec31aQ3UPL0 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sec31aQ3UPL0 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sec31aQ3UPL0 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sec31aQ3UPL0 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sec31aQ3UPL0 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sec31aQ3UPL0 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Sec31aQ3UPL0 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sec31aQ3UPL0 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sec31aQ3UPL0 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sec31aQ3UPL0 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sec31aQ3UPL0 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sec31aQ3UPL0 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Sec31aQ3UPL0 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sec31aQ3UPL0 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sec31aQ3UPL0 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sec31aQ3UPL0 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sec31aQ3UPL0 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sec31aQ3UPL0 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sec31aQ3UPL0 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sec31aQ3UPL0 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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