Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPE3

Rmi2, RecQ-mediated genome instability protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 149 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rmi2Q3UPE3 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC8.82□□□□□ -1
Rmi2Q3UPE3 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC8.82□□□□□ -1
Rmi2Q3UPE3 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC8.82□□□□□ -1
Rmi2Q3UPE3 Abca3-202ENSMUST00000079594 6380 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.82□□□□□ -1
Rmi2Q3UPE3 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Rmi2Q3UPE3 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC8.82□□□□□ -1
Rmi2Q3UPE3 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC8.82□□□□□ -1
Rmi2Q3UPE3 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Rmi2Q3UPE3 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Rmi2Q3UPE3 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Rmi2Q3UPE3 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Rmi2Q3UPE3 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Rmi2Q3UPE3 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Rmi2Q3UPE3 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Rmi2Q3UPE3 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Rmi2Q3UPE3 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC8.82□□□□□ -1
Rmi2Q3UPE3 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Rmi2Q3UPE3 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Rmi2Q3UPE3 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Rmi2Q3UPE3 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Rmi2Q3UPE3 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.82□□□□□ -1
Rmi2Q3UPE3 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Rmi2Q3UPE3 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Rmi2Q3UPE3 Cbl-211ENSMUST00000206720 11372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Rmi2Q3UPE3 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Rmi2Q3UPE3 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Rmi2Q3UPE3 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.81□□□□□ -1
Rmi2Q3UPE3 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC8.81□□□□□ -1
Rmi2Q3UPE3 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Rmi2Q3UPE3 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Rmi2Q3UPE3 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Rmi2Q3UPE3 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Rmi2Q3UPE3 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Rmi2Q3UPE3 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Rmi2Q3UPE3 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Rmi2Q3UPE3 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Rmi2Q3UPE3 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Rmi2Q3UPE3 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Rmi2Q3UPE3 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.81□□□□□ -1
Rmi2Q3UPE3 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Rmi2Q3UPE3 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.81□□□□□ -1
Rmi2Q3UPE3 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC8.81□□□□□ -1
Rmi2Q3UPE3 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Rmi2Q3UPE3 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Rmi2Q3UPE3 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Rmi2Q3UPE3 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Rmi2Q3UPE3 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Rmi2Q3UPE3 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC8.81□□□□□ -1
Rmi2Q3UPE3 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Rmi2Q3UPE3 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC8.81□□□□□ -1
Rmi2Q3UPE3 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC8.81□□□□□ -1
Rmi2Q3UPE3 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC8.81□□□□□ -1
Rmi2Q3UPE3 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.81□□□□□ -1
Rmi2Q3UPE3 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.81□□□□□ -1
Rmi2Q3UPE3 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC8.81□□□□□ -1
Rmi2Q3UPE3 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC8.81□□□□□ -1
Rmi2Q3UPE3 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC8.81□□□□□ -1
Rmi2Q3UPE3 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC8.81□□□□□ -1
Rmi2Q3UPE3 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC8.81□□□□□ -1
Rmi2Q3UPE3 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Rmi2Q3UPE3 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Rmi2Q3UPE3 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Rmi2Q3UPE3 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Rmi2Q3UPE3 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Rmi2Q3UPE3 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Rmi2Q3UPE3 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Rmi2Q3UPE3 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC8.81□□□□□ -1
Rmi2Q3UPE3 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.81□□□□□ -1
Rmi2Q3UPE3 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC8.81□□□□□ -1
Rmi2Q3UPE3 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Rmi2Q3UPE3 Ptprt-204ENSMUST00000109445 12082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Rmi2Q3UPE3 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Rmi2Q3UPE3 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Rmi2Q3UPE3 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Rmi2Q3UPE3 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Rmi2Q3UPE3 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Rmi2Q3UPE3 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Rmi2Q3UPE3 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Rmi2Q3UPE3 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Rmi2Q3UPE3 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.81□□□□□ -1
Rmi2Q3UPE3 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Rmi2Q3UPE3 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Rmi2Q3UPE3 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Rmi2Q3UPE3 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Rmi2Q3UPE3 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Rmi2Q3UPE3 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
Rmi2Q3UPE3 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Rmi2Q3UPE3 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Rmi2Q3UPE3 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Rmi2Q3UPE3 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Rmi2Q3UPE3 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Rmi2Q3UPE3 4632427E13Rik-202ENSMUST00000147198 6559 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Rmi2Q3UPE3 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Rmi2Q3UPE3 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
Rmi2Q3UPE3 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Rmi2Q3UPE3 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Rmi2Q3UPE3 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Rmi2Q3UPE3 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Rmi2Q3UPE3 Poc5-201ENSMUST00000099295 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Rmi2Q3UPE3 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms