Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHX8

Nkx6-3, Homeobox protein Nkx-6.3, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx6-3Q3UHX8 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
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Nkx6-3Q3UHX8 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Nkx6-3Q3UHX8 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Nkx6-3Q3UHX8 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Nkx6-3Q3UHX8 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Nkx6-3Q3UHX8 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Nkx6-3Q3UHX8 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Nkx6-3Q3UHX8 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
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Nkx6-3Q3UHX8 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
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Nkx6-3Q3UHX8 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Nkx6-3Q3UHX8 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Nkx6-3Q3UHX8 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Nkx6-3Q3UHX8 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Nkx6-3Q3UHX8 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Nkx6-3Q3UHX8 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Nkx6-3Q3UHX8 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Nkx6-3Q3UHX8 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Nkx6-3Q3UHX8 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Nkx6-3Q3UHX8 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
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Nkx6-3Q3UHX8 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Nkx6-3Q3UHX8 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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Nkx6-3Q3UHX8 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Nkx6-3Q3UHX8 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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Nkx6-3Q3UHX8 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Nkx6-3Q3UHX8 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
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Nkx6-3Q3UHX8 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Nkx6-3Q3UHX8 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
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Nkx6-3Q3UHX8 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
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Nkx6-3Q3UHX8 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
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Nkx6-3Q3UHX8 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Nkx6-3Q3UHX8 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
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Nkx6-3Q3UHX8 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Nkx6-3Q3UHX8 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Nkx6-3Q3UHX8 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Nkx6-3Q3UHX8 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
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Nkx6-3Q3UHX8 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Nkx6-3Q3UHX8 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Nkx6-3Q3UHX8 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Nkx6-3Q3UHX8 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Nkx6-3Q3UHX8 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Nkx6-3Q3UHX8 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Nkx6-3Q3UHX8 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Nkx6-3Q3UHX8 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Nkx6-3Q3UHX8 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.6 ms