Protein–RNA interactions for Protein: Q3U827

Rnf180, E3 ubiquitin-protein ligase RNF180, mousemouse

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Length 592 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf180Q3U827 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rnf180Q3U827 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rnf180Q3U827 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rnf180Q3U827 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rnf180Q3U827 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Rnf180Q3U827 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Rnf180Q3U827 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Rnf180Q3U827 A530032D15Rik-201ENSMUST00000160792 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Rnf180Q3U827 Triml2-201ENSMUST00000163869 1467 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Rnf180Q3U827 Hspa14-201ENSMUST00000027961 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Rnf180Q3U827 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Rnf180Q3U827 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rnf180Q3U827 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rnf180Q3U827 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rnf180Q3U827 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rnf180Q3U827 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rnf180Q3U827 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rnf180Q3U827 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rnf180Q3U827 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rnf180Q3U827 Atp5s-204ENSMUST00000220916 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rnf180Q3U827 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rnf180Q3U827 Tomm5-201ENSMUST00000107807 442 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rnf180Q3U827 Tomm5-202ENSMUST00000107808 679 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rnf180Q3U827 Ralyl-202ENSMUST00000108373 267 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rnf180Q3U827 Tprkb-204ENSMUST00000113752 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rnf180Q3U827 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Rnf180Q3U827 Gm14717-201ENSMUST00000140450 649 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rnf180Q3U827 Gm13272-201ENSMUST00000179425 811 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rnf180Q3U827 Gm45310-201ENSMUST00000210436 275 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Rnf180Q3U827 BC049987-201ENSMUST00000213859 918 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rnf180Q3U827 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rnf180Q3U827 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rnf180Q3U827 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rnf180Q3U827 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rnf180Q3U827 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rnf180Q3U827 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rnf180Q3U827 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rnf180Q3U827 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rnf180Q3U827 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rnf180Q3U827 Matr3-216ENSMUST00000190653 1846 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rnf180Q3U827 Snhg18-201ENSMUST00000181536 1486 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rnf180Q3U827 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rnf180Q3U827 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rnf180Q3U827 Plek2-201ENSMUST00000021544 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rnf180Q3U827 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rnf180Q3U827 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rnf180Q3U827 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rnf180Q3U827 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rnf180Q3U827 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rnf180Q3U827 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Rnf180Q3U827 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
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Rnf180Q3U827 Apoe-210ENSMUST00000174710 514 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rnf180Q3U827 Gm27241-202ENSMUST00000185013 570 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Rnf180Q3U827 Prss51-204ENSMUST00000224112 1042 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rnf180Q3U827 1700013F07Rik-201ENSMUST00000029485 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rnf180Q3U827 2310057N15Rik-201ENSMUST00000054223 1028 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rnf180Q3U827 Vmn1r44-201ENSMUST00000089420 1108 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rnf180Q3U827 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rnf180Q3U827 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rnf180Q3U827 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rnf180Q3U827 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rnf180Q3U827 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rnf180Q3U827 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rnf180Q3U827 Gm13556-201ENSMUST00000132692 1412 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rnf180Q3U827 Gm26632-201ENSMUST00000181120 1400 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rnf180Q3U827 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rnf180Q3U827 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rnf180Q3U827 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rnf180Q3U827 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rnf180Q3U827 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rnf180Q3U827 Ccna1-204ENSMUST00000198320 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rnf180Q3U827 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rnf180Q3U827 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rnf180Q3U827 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rnf180Q3U827 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rnf180Q3U827 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rnf180Q3U827 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rnf180Q3U827 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rnf180Q3U827 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rnf180Q3U827 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rnf180Q3U827 Cidec-203ENSMUST00000113091 785 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rnf180Q3U827 Gm13117-201ENSMUST00000120894 691 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Rnf180Q3U827 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rnf180Q3U827 Ppt1-204ENSMUST00000121870 986 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rnf180Q3U827 n-R5s84-201ENSMUST00000122591 109 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Rnf180Q3U827 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rnf180Q3U827 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rnf180Q3U827 Prdx2-208ENSMUST00000164807 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rnf180Q3U827 Gm25677-201ENSMUST00000174983 72 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Rnf180Q3U827 Vmn1r206-201ENSMUST00000187140 1135 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
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