Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3Q1

Ulk3, Serine/threonine-protein kinase ULK3, mousemouse

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Length 472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk3Q3U3Q1 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Ulk3Q3U3Q1 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ulk3Q3U3Q1 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ulk3Q3U3Q1 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ulk3Q3U3Q1 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ulk3Q3U3Q1 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ulk3Q3U3Q1 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ulk3Q3U3Q1 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ulk3Q3U3Q1 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ulk3Q3U3Q1 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ulk3Q3U3Q1 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ulk3Q3U3Q1 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ulk3Q3U3Q1 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Ulk3Q3U3Q1 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ulk3Q3U3Q1 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Ulk3Q3U3Q1 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ulk3Q3U3Q1 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ulk3Q3U3Q1 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ulk3Q3U3Q1 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ulk3Q3U3Q1 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ulk3Q3U3Q1 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ulk3Q3U3Q1 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Ulk3Q3U3Q1 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ulk3Q3U3Q1 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ulk3Q3U3Q1 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ulk3Q3U3Q1 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ulk3Q3U3Q1 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Ulk3Q3U3Q1 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ulk3Q3U3Q1 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Ulk3Q3U3Q1 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Ulk3Q3U3Q1 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ulk3Q3U3Q1 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ulk3Q3U3Q1 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ulk3Q3U3Q1 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ulk3Q3U3Q1 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ulk3Q3U3Q1 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ulk3Q3U3Q1 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ulk3Q3U3Q1 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ulk3Q3U3Q1 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ulk3Q3U3Q1 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ulk3Q3U3Q1 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Ulk3Q3U3Q1 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ulk3Q3U3Q1 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ulk3Q3U3Q1 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ulk3Q3U3Q1 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ulk3Q3U3Q1 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ulk3Q3U3Q1 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Ulk3Q3U3Q1 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Ulk3Q3U3Q1 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Ulk3Q3U3Q1 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Ulk3Q3U3Q1 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Ulk3Q3U3Q1 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Ulk3Q3U3Q1 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ulk3Q3U3Q1 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ulk3Q3U3Q1 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ulk3Q3U3Q1 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ulk3Q3U3Q1 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ulk3Q3U3Q1 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ulk3Q3U3Q1 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ulk3Q3U3Q1 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ulk3Q3U3Q1 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ulk3Q3U3Q1 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ulk3Q3U3Q1 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ulk3Q3U3Q1 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ulk3Q3U3Q1 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ulk3Q3U3Q1 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ulk3Q3U3Q1 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ulk3Q3U3Q1 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ulk3Q3U3Q1 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ulk3Q3U3Q1 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ulk3Q3U3Q1 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ulk3Q3U3Q1 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Ulk3Q3U3Q1 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ulk3Q3U3Q1 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ulk3Q3U3Q1 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ulk3Q3U3Q1 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ulk3Q3U3Q1 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ulk3Q3U3Q1 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ulk3Q3U3Q1 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ulk3Q3U3Q1 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Ulk3Q3U3Q1 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ulk3Q3U3Q1 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ulk3Q3U3Q1 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ulk3Q3U3Q1 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ulk3Q3U3Q1 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ulk3Q3U3Q1 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Ulk3Q3U3Q1 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ulk3Q3U3Q1 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ulk3Q3U3Q1 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ulk3Q3U3Q1 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ulk3Q3U3Q1 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ulk3Q3U3Q1 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ulk3Q3U3Q1 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ulk3Q3U3Q1 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ulk3Q3U3Q1 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ulk3Q3U3Q1 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ulk3Q3U3Q1 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ulk3Q3U3Q1 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ulk3Q3U3Q1 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ulk3Q3U3Q1 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms