Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2C5

Rnf149, E3 ubiquitin-protein ligase RNF149, mousemouse

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Length 394 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf149Q3U2C5 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
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Rnf149Q3U2C5 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
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Rnf149Q3U2C5 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rnf149Q3U2C5 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rnf149Q3U2C5 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
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Rnf149Q3U2C5 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
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