Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0M1

Trappc9, Trafficking protein particle complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc9Q3U0M1 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trappc9Q3U0M1 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trappc9Q3U0M1 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trappc9Q3U0M1 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trappc9Q3U0M1 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trappc9Q3U0M1 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trappc9Q3U0M1 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Trappc9Q3U0M1 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trappc9Q3U0M1 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trappc9Q3U0M1 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trappc9Q3U0M1 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trappc9Q3U0M1 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trappc9Q3U0M1 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trappc9Q3U0M1 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trappc9Q3U0M1 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trappc9Q3U0M1 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trappc9Q3U0M1 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trappc9Q3U0M1 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trappc9Q3U0M1 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trappc9Q3U0M1 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trappc9Q3U0M1 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trappc9Q3U0M1 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trappc9Q3U0M1 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trappc9Q3U0M1 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trappc9Q3U0M1 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trappc9Q3U0M1 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trappc9Q3U0M1 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trappc9Q3U0M1 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trappc9Q3U0M1 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trappc9Q3U0M1 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trappc9Q3U0M1 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Trappc9Q3U0M1 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Trappc9Q3U0M1 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trappc9Q3U0M1 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trappc9Q3U0M1 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trappc9Q3U0M1 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trappc9Q3U0M1 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trappc9Q3U0M1 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Trappc9Q3U0M1 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Trappc9Q3U0M1 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Trappc9Q3U0M1 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trappc9Q3U0M1 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trappc9Q3U0M1 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trappc9Q3U0M1 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Trappc9Q3U0M1 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Trappc9Q3U0M1 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Trappc9Q3U0M1 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trappc9Q3U0M1 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trappc9Q3U0M1 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trappc9Q3U0M1 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trappc9Q3U0M1 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Trappc9Q3U0M1 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Trappc9Q3U0M1 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Trappc9Q3U0M1 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Trappc9Q3U0M1 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
Trappc9Q3U0M1 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trappc9Q3U0M1 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trappc9Q3U0M1 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trappc9Q3U0M1 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trappc9Q3U0M1 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trappc9Q3U0M1 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trappc9Q3U0M1 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trappc9Q3U0M1 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trappc9Q3U0M1 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trappc9Q3U0M1 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trappc9Q3U0M1 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trappc9Q3U0M1 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trappc9Q3U0M1 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trappc9Q3U0M1 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trappc9Q3U0M1 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trappc9Q3U0M1 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Trappc9Q3U0M1 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Trappc9Q3U0M1 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trappc9Q3U0M1 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trappc9Q3U0M1 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trappc9Q3U0M1 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trappc9Q3U0M1 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trappc9Q3U0M1 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trappc9Q3U0M1 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trappc9Q3U0M1 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trappc9Q3U0M1 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trappc9Q3U0M1 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trappc9Q3U0M1 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trappc9Q3U0M1 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trappc9Q3U0M1 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trappc9Q3U0M1 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trappc9Q3U0M1 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trappc9Q3U0M1 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trappc9Q3U0M1 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trappc9Q3U0M1 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trappc9Q3U0M1 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Trappc9Q3U0M1 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trappc9Q3U0M1 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trappc9Q3U0M1 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Trappc9Q3U0M1 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trappc9Q3U0M1 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trappc9Q3U0M1 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trappc9Q3U0M1 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trappc9Q3U0M1 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Trappc9Q3U0M1 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 107.4 ms