Protein–RNA interactions for Protein: Q1RLL3

Cpne9, Copine-9, mousemouse

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne9Q1RLL3 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cpne9Q1RLL3 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cpne9Q1RLL3 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Cpne9Q1RLL3 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cpne9Q1RLL3 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cpne9Q1RLL3 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cpne9Q1RLL3 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cpne9Q1RLL3 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cpne9Q1RLL3 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cpne9Q1RLL3 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cpne9Q1RLL3 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cpne9Q1RLL3 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cpne9Q1RLL3 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cpne9Q1RLL3 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cpne9Q1RLL3 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cpne9Q1RLL3 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cpne9Q1RLL3 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cpne9Q1RLL3 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Cpne9Q1RLL3 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Cpne9Q1RLL3 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Cpne9Q1RLL3 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cpne9Q1RLL3 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cpne9Q1RLL3 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cpne9Q1RLL3 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cpne9Q1RLL3 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cpne9Q1RLL3 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cpne9Q1RLL3 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Cpne9Q1RLL3 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Cpne9Q1RLL3 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cpne9Q1RLL3 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Cpne9Q1RLL3 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cpne9Q1RLL3 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cpne9Q1RLL3 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Cpne9Q1RLL3 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cpne9Q1RLL3 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cpne9Q1RLL3 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cpne9Q1RLL3 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cpne9Q1RLL3 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cpne9Q1RLL3 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cpne9Q1RLL3 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cpne9Q1RLL3 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cpne9Q1RLL3 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cpne9Q1RLL3 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cpne9Q1RLL3 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cpne9Q1RLL3 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cpne9Q1RLL3 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cpne9Q1RLL3 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cpne9Q1RLL3 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cpne9Q1RLL3 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cpne9Q1RLL3 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cpne9Q1RLL3 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cpne9Q1RLL3 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cpne9Q1RLL3 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cpne9Q1RLL3 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cpne9Q1RLL3 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cpne9Q1RLL3 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Cpne9Q1RLL3 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Cpne9Q1RLL3 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cpne9Q1RLL3 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cpne9Q1RLL3 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cpne9Q1RLL3 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cpne9Q1RLL3 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cpne9Q1RLL3 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cpne9Q1RLL3 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cpne9Q1RLL3 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cpne9Q1RLL3 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Cpne9Q1RLL3 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cpne9Q1RLL3 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cpne9Q1RLL3 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cpne9Q1RLL3 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cpne9Q1RLL3 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Cpne9Q1RLL3 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Cpne9Q1RLL3 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cpne9Q1RLL3 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cpne9Q1RLL3 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cpne9Q1RLL3 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cpne9Q1RLL3 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cpne9Q1RLL3 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cpne9Q1RLL3 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cpne9Q1RLL3 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cpne9Q1RLL3 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cpne9Q1RLL3 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cpne9Q1RLL3 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cpne9Q1RLL3 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cpne9Q1RLL3 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cpne9Q1RLL3 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cpne9Q1RLL3 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cpne9Q1RLL3 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cpne9Q1RLL3 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cpne9Q1RLL3 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cpne9Q1RLL3 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cpne9Q1RLL3 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cpne9Q1RLL3 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Cpne9Q1RLL3 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cpne9Q1RLL3 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cpne9Q1RLL3 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cpne9Q1RLL3 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cpne9Q1RLL3 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Cpne9Q1RLL3 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cpne9Q1RLL3 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
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