Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGU4

Vgf, MCG18019, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VgfQ0VGU4 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VgfQ0VGU4 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VgfQ0VGU4 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VgfQ0VGU4 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
VgfQ0VGU4 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VgfQ0VGU4 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VgfQ0VGU4 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VgfQ0VGU4 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VgfQ0VGU4 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VgfQ0VGU4 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VgfQ0VGU4 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VgfQ0VGU4 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VgfQ0VGU4 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VgfQ0VGU4 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VgfQ0VGU4 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VgfQ0VGU4 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VgfQ0VGU4 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
VgfQ0VGU4 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VgfQ0VGU4 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VgfQ0VGU4 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VgfQ0VGU4 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VgfQ0VGU4 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VgfQ0VGU4 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VgfQ0VGU4 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VgfQ0VGU4 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
VgfQ0VGU4 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
VgfQ0VGU4 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VgfQ0VGU4 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VgfQ0VGU4 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
VgfQ0VGU4 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
VgfQ0VGU4 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VgfQ0VGU4 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VgfQ0VGU4 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VgfQ0VGU4 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VgfQ0VGU4 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VgfQ0VGU4 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
VgfQ0VGU4 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VgfQ0VGU4 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VgfQ0VGU4 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VgfQ0VGU4 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VgfQ0VGU4 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VgfQ0VGU4 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VgfQ0VGU4 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VgfQ0VGU4 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VgfQ0VGU4 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VgfQ0VGU4 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VgfQ0VGU4 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VgfQ0VGU4 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VgfQ0VGU4 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VgfQ0VGU4 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
VgfQ0VGU4 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VgfQ0VGU4 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
VgfQ0VGU4 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VgfQ0VGU4 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VgfQ0VGU4 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
VgfQ0VGU4 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VgfQ0VGU4 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
VgfQ0VGU4 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
VgfQ0VGU4 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VgfQ0VGU4 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
VgfQ0VGU4 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VgfQ0VGU4 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
VgfQ0VGU4 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VgfQ0VGU4 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VgfQ0VGU4 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VgfQ0VGU4 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VgfQ0VGU4 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VgfQ0VGU4 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VgfQ0VGU4 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VgfQ0VGU4 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VgfQ0VGU4 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VgfQ0VGU4 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VgfQ0VGU4 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VgfQ0VGU4 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VgfQ0VGU4 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VgfQ0VGU4 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VgfQ0VGU4 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VgfQ0VGU4 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
VgfQ0VGU4 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
VgfQ0VGU4 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
VgfQ0VGU4 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VgfQ0VGU4 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VgfQ0VGU4 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VgfQ0VGU4 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VgfQ0VGU4 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
VgfQ0VGU4 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
VgfQ0VGU4 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VgfQ0VGU4 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VgfQ0VGU4 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VgfQ0VGU4 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
VgfQ0VGU4 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
VgfQ0VGU4 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
VgfQ0VGU4 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
VgfQ0VGU4 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
VgfQ0VGU4 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VgfQ0VGU4 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
VgfQ0VGU4 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
VgfQ0VGU4 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
VgfQ0VGU4 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
VgfQ0VGU4 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms