Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF76

Ttc39d, Tetratricopeptide repeat domain 39D, mousemouse

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Length 604 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39dQ0VF76 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ttc39dQ0VF76 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ttc39dQ0VF76 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ttc39dQ0VF76 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ttc39dQ0VF76 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ttc39dQ0VF76 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ttc39dQ0VF76 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ttc39dQ0VF76 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ttc39dQ0VF76 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ttc39dQ0VF76 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ttc39dQ0VF76 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ttc39dQ0VF76 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ttc39dQ0VF76 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ttc39dQ0VF76 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ttc39dQ0VF76 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ttc39dQ0VF76 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ttc39dQ0VF76 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ttc39dQ0VF76 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ttc39dQ0VF76 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ttc39dQ0VF76 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ttc39dQ0VF76 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ttc39dQ0VF76 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ttc39dQ0VF76 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ttc39dQ0VF76 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ttc39dQ0VF76 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ttc39dQ0VF76 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ttc39dQ0VF76 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ttc39dQ0VF76 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ttc39dQ0VF76 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ttc39dQ0VF76 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ttc39dQ0VF76 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ttc39dQ0VF76 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ttc39dQ0VF76 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ttc39dQ0VF76 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ttc39dQ0VF76 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ttc39dQ0VF76 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ttc39dQ0VF76 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ttc39dQ0VF76 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ttc39dQ0VF76 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ttc39dQ0VF76 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ttc39dQ0VF76 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ttc39dQ0VF76 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttc39dQ0VF76 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttc39dQ0VF76 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttc39dQ0VF76 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttc39dQ0VF76 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttc39dQ0VF76 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttc39dQ0VF76 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttc39dQ0VF76 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttc39dQ0VF76 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttc39dQ0VF76 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttc39dQ0VF76 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttc39dQ0VF76 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttc39dQ0VF76 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
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Ttc39dQ0VF76 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttc39dQ0VF76 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttc39dQ0VF76 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttc39dQ0VF76 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttc39dQ0VF76 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttc39dQ0VF76 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttc39dQ0VF76 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttc39dQ0VF76 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttc39dQ0VF76 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
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Ttc39dQ0VF76 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttc39dQ0VF76 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttc39dQ0VF76 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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Ttc39dQ0VF76 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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Ttc39dQ0VF76 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc39dQ0VF76 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc39dQ0VF76 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc39dQ0VF76 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc39dQ0VF76 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc39dQ0VF76 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc39dQ0VF76 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc39dQ0VF76 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc39dQ0VF76 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc39dQ0VF76 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc39dQ0VF76 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc39dQ0VF76 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc39dQ0VF76 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc39dQ0VF76 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc39dQ0VF76 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc39dQ0VF76 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc39dQ0VF76 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc39dQ0VF76 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc39dQ0VF76 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc39dQ0VF76 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc39dQ0VF76 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc39dQ0VF76 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc39dQ0VF76 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc39dQ0VF76 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc39dQ0VF76 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc39dQ0VF76 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc39dQ0VF76 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
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