Protein–RNA interactions for Protein: Q0VDN7

Rundc1, RUN domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc1Q0VDN7 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rundc1Q0VDN7 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Rundc1Q0VDN7 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Rundc1Q0VDN7 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rundc1Q0VDN7 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rundc1Q0VDN7 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Rundc1Q0VDN7 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rundc1Q0VDN7 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rundc1Q0VDN7 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rundc1Q0VDN7 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Rundc1Q0VDN7 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Rundc1Q0VDN7 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rundc1Q0VDN7 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rundc1Q0VDN7 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rundc1Q0VDN7 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rundc1Q0VDN7 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rundc1Q0VDN7 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rundc1Q0VDN7 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rundc1Q0VDN7 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rundc1Q0VDN7 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rundc1Q0VDN7 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rundc1Q0VDN7 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rundc1Q0VDN7 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rundc1Q0VDN7 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rundc1Q0VDN7 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rundc1Q0VDN7 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rundc1Q0VDN7 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rundc1Q0VDN7 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rundc1Q0VDN7 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rundc1Q0VDN7 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rundc1Q0VDN7 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rundc1Q0VDN7 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Rundc1Q0VDN7 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rundc1Q0VDN7 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rundc1Q0VDN7 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Rundc1Q0VDN7 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rundc1Q0VDN7 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Rundc1Q0VDN7 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Rundc1Q0VDN7 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Rundc1Q0VDN7 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rundc1Q0VDN7 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rundc1Q0VDN7 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rundc1Q0VDN7 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rundc1Q0VDN7 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Rundc1Q0VDN7 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Rundc1Q0VDN7 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rundc1Q0VDN7 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rundc1Q0VDN7 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rundc1Q0VDN7 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rundc1Q0VDN7 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rundc1Q0VDN7 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rundc1Q0VDN7 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rundc1Q0VDN7 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Rundc1Q0VDN7 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rundc1Q0VDN7 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Rundc1Q0VDN7 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rundc1Q0VDN7 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rundc1Q0VDN7 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rundc1Q0VDN7 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rundc1Q0VDN7 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rundc1Q0VDN7 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Rundc1Q0VDN7 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rundc1Q0VDN7 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Rundc1Q0VDN7 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rundc1Q0VDN7 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rundc1Q0VDN7 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rundc1Q0VDN7 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Rundc1Q0VDN7 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Rundc1Q0VDN7 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rundc1Q0VDN7 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Rundc1Q0VDN7 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rundc1Q0VDN7 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rundc1Q0VDN7 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rundc1Q0VDN7 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rundc1Q0VDN7 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rundc1Q0VDN7 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rundc1Q0VDN7 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rundc1Q0VDN7 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rundc1Q0VDN7 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rundc1Q0VDN7 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rundc1Q0VDN7 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rundc1Q0VDN7 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Rundc1Q0VDN7 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Rundc1Q0VDN7 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rundc1Q0VDN7 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Rundc1Q0VDN7 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rundc1Q0VDN7 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rundc1Q0VDN7 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rundc1Q0VDN7 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rundc1Q0VDN7 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rundc1Q0VDN7 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rundc1Q0VDN7 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rundc1Q0VDN7 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rundc1Q0VDN7 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rundc1Q0VDN7 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rundc1Q0VDN7 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rundc1Q0VDN7 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rundc1Q0VDN7 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rundc1Q0VDN7 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rundc1Q0VDN7 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.7 ms