Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBF8

Stum, Protein stum homolog, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
StumQ0VBF8 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
StumQ0VBF8 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
StumQ0VBF8 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
StumQ0VBF8 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
StumQ0VBF8 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
StumQ0VBF8 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
StumQ0VBF8 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
StumQ0VBF8 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
StumQ0VBF8 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
StumQ0VBF8 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
StumQ0VBF8 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.67
StumQ0VBF8 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
StumQ0VBF8 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
StumQ0VBF8 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
StumQ0VBF8 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
StumQ0VBF8 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
StumQ0VBF8 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
StumQ0VBF8 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
StumQ0VBF8 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
StumQ0VBF8 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
StumQ0VBF8 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
StumQ0VBF8 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
StumQ0VBF8 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
StumQ0VBF8 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
StumQ0VBF8 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
StumQ0VBF8 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
StumQ0VBF8 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
StumQ0VBF8 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
StumQ0VBF8 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
StumQ0VBF8 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
StumQ0VBF8 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
StumQ0VBF8 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
StumQ0VBF8 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
StumQ0VBF8 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
StumQ0VBF8 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
StumQ0VBF8 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
StumQ0VBF8 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
StumQ0VBF8 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
StumQ0VBF8 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
StumQ0VBF8 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
StumQ0VBF8 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC10.83□□□□□ -0.68
StumQ0VBF8 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
StumQ0VBF8 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
StumQ0VBF8 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
StumQ0VBF8 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
StumQ0VBF8 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
StumQ0VBF8 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
StumQ0VBF8 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
StumQ0VBF8 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
StumQ0VBF8 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
StumQ0VBF8 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
StumQ0VBF8 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
StumQ0VBF8 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
StumQ0VBF8 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
StumQ0VBF8 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
StumQ0VBF8 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
StumQ0VBF8 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
StumQ0VBF8 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
StumQ0VBF8 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
StumQ0VBF8 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
StumQ0VBF8 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
StumQ0VBF8 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
StumQ0VBF8 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
StumQ0VBF8 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
StumQ0VBF8 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
StumQ0VBF8 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
StumQ0VBF8 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
StumQ0VBF8 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
StumQ0VBF8 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
StumQ0VBF8 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
StumQ0VBF8 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC10.82□□□□□ -0.68
StumQ0VBF8 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
StumQ0VBF8 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
StumQ0VBF8 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
StumQ0VBF8 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC10.82□□□□□ -0.68
StumQ0VBF8 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
StumQ0VBF8 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
StumQ0VBF8 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
StumQ0VBF8 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
StumQ0VBF8 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
StumQ0VBF8 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
StumQ0VBF8 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
StumQ0VBF8 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
StumQ0VBF8 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
StumQ0VBF8 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC10.82□□□□□ -0.68
StumQ0VBF8 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
StumQ0VBF8 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
StumQ0VBF8 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
StumQ0VBF8 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
StumQ0VBF8 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
StumQ0VBF8 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
StumQ0VBF8 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
StumQ0VBF8 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
StumQ0VBF8 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
StumQ0VBF8 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
StumQ0VBF8 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
StumQ0VBF8 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
StumQ0VBF8 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
StumQ0VBF8 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC10.82□□□□□ -0.68
StumQ0VBF8 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.5 ms