Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBD0

Itgb8, Integrin beta, mousemouse

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Length 767 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb8Q0VBD0 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Itgb8Q0VBD0 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Itgb8Q0VBD0 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Itgb8Q0VBD0 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Itgb8Q0VBD0 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Itgb8Q0VBD0 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Itgb8Q0VBD0 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Itgb8Q0VBD0 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Itgb8Q0VBD0 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Itgb8Q0VBD0 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Itgb8Q0VBD0 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Itgb8Q0VBD0 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Itgb8Q0VBD0 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Itgb8Q0VBD0 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Itgb8Q0VBD0 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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Itgb8Q0VBD0 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Itgb8Q0VBD0 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Itgb8Q0VBD0 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Itgb8Q0VBD0 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Itgb8Q0VBD0 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Itgb8Q0VBD0 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Itgb8Q0VBD0 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Itgb8Q0VBD0 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Itgb8Q0VBD0 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Itgb8Q0VBD0 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Itgb8Q0VBD0 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Itgb8Q0VBD0 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Itgb8Q0VBD0 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Itgb8Q0VBD0 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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Itgb8Q0VBD0 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Itgb8Q0VBD0 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Itgb8Q0VBD0 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Itgb8Q0VBD0 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Itgb8Q0VBD0 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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Itgb8Q0VBD0 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Itgb8Q0VBD0 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Itgb8Q0VBD0 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Itgb8Q0VBD0 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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Itgb8Q0VBD0 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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Itgb8Q0VBD0 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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Itgb8Q0VBD0 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Itgb8Q0VBD0 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Itgb8Q0VBD0 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Itgb8Q0VBD0 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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Itgb8Q0VBD0 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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Itgb8Q0VBD0 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Itgb8Q0VBD0 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Itgb8Q0VBD0 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Itgb8Q0VBD0 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Itgb8Q0VBD0 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Itgb8Q0VBD0 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
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Itgb8Q0VBD0 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
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Itgb8Q0VBD0 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
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Itgb8Q0VBD0 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Itgb8Q0VBD0 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Itgb8Q0VBD0 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Itgb8Q0VBD0 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Itgb8Q0VBD0 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Itgb8Q0VBD0 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
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Itgb8Q0VBD0 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Itgb8Q0VBD0 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Itgb8Q0VBD0 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Itgb8Q0VBD0 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Itgb8Q0VBD0 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Itgb8Q0VBD0 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Itgb8Q0VBD0 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.9 ms