Protein–RNA interactions for Protein: Q0VB07

Pglyrp4, Peptidoglycan recognition protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pglyrp4Q0VB07 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Pglyrp4Q0VB07 Megf10-201ENSMUST00000075770 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Pglyrp4Q0VB07 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Pglyrp4Q0VB07 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Pglyrp4Q0VB07 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Pglyrp4Q0VB07 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Pglyrp4Q0VB07 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Pglyrp4Q0VB07 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Pglyrp4Q0VB07 Col6a3-201ENSMUST00000056925 10106 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Pglyrp4Q0VB07 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Pglyrp4Q0VB07 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Pglyrp4Q0VB07 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Pglyrp4Q0VB07 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Pglyrp4Q0VB07 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Pglyrp4Q0VB07 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Pglyrp4Q0VB07 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Pglyrp4Q0VB07 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Pglyrp4Q0VB07 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Pglyrp4Q0VB07 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Pglyrp4Q0VB07 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Pglyrp4Q0VB07 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Pglyrp4Q0VB07 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Pglyrp4Q0VB07 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Pglyrp4Q0VB07 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Pglyrp4Q0VB07 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Pglyrp4Q0VB07 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Pglyrp4Q0VB07 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Pglyrp4Q0VB07 Slc12a7-201ENSMUST00000017900 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Pglyrp4Q0VB07 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Pglyrp4Q0VB07 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Pglyrp4Q0VB07 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Pglyrp4Q0VB07 Anxa7-202ENSMUST00000100844 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Pglyrp4Q0VB07 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Pglyrp4Q0VB07 Scn10a-204ENSMUST00000214408 5877 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Pglyrp4Q0VB07 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Pglyrp4Q0VB07 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Pglyrp4Q0VB07 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Pglyrp4Q0VB07 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Pglyrp4Q0VB07 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Pglyrp4Q0VB07 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Pglyrp4Q0VB07 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Pglyrp4Q0VB07 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Pglyrp4Q0VB07 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Pglyrp4Q0VB07 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Pglyrp4Q0VB07 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Pglyrp4Q0VB07 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Pglyrp4Q0VB07 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Pglyrp4Q0VB07 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Pglyrp4Q0VB07 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Pglyrp4Q0VB07 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Pglyrp4Q0VB07 Fam186a-202ENSMUST00000100209 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Pglyrp4Q0VB07 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Pglyrp4Q0VB07 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Pglyrp4Q0VB07 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Pglyrp4Q0VB07 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Pglyrp4Q0VB07 Srp54b-202ENSMUST00000218879 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Pglyrp4Q0VB07 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Pglyrp4Q0VB07 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Pglyrp4Q0VB07 Gm18262-201ENSMUST00000222560 1946 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
Pglyrp4Q0VB07 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Pglyrp4Q0VB07 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Pglyrp4Q0VB07 Scn10a-202ENSMUST00000213392 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Pglyrp4Q0VB07 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Pglyrp4Q0VB07 Calcoco1-204ENSMUST00000171838 2968 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Pglyrp4Q0VB07 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Pglyrp4Q0VB07 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Pglyrp4Q0VB07 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
Pglyrp4Q0VB07 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Pglyrp4Q0VB07 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Pglyrp4Q0VB07 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
Pglyrp4Q0VB07 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Pglyrp4Q0VB07 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Pglyrp4Q0VB07 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Pglyrp4Q0VB07 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Pglyrp4Q0VB07 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Pglyrp4Q0VB07 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Pglyrp4Q0VB07 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
Pglyrp4Q0VB07 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Pglyrp4Q0VB07 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
Pglyrp4Q0VB07 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Pglyrp4Q0VB07 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Pglyrp4Q0VB07 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
Pglyrp4Q0VB07 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Pglyrp4Q0VB07 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
Pglyrp4Q0VB07 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Pglyrp4Q0VB07 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Pglyrp4Q0VB07 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Pglyrp4Q0VB07 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Pglyrp4Q0VB07 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Pglyrp4Q0VB07 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Pglyrp4Q0VB07 Tjp1-201ENSMUST00000032729 6102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Pglyrp4Q0VB07 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Pglyrp4Q0VB07 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Pglyrp4Q0VB07 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Pglyrp4Q0VB07 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Pglyrp4Q0VB07 Tbc1d17-201ENSMUST00000047085 8750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Pglyrp4Q0VB07 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Pglyrp4Q0VB07 Tat-201ENSMUST00000001720 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Pglyrp4Q0VB07 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Pglyrp4Q0VB07 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms