Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5W1

Vps8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps8Q0P5W1 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Vps8Q0P5W1 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Vps8Q0P5W1 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Vps8Q0P5W1 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Vps8Q0P5W1 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Vps8Q0P5W1 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Vps8Q0P5W1 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Vps8Q0P5W1 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Vps8Q0P5W1 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Vps8Q0P5W1 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Vps8Q0P5W1 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Vps8Q0P5W1 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Vps8Q0P5W1 Gm14662-201ENSMUST00000145552 734 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Vps8Q0P5W1 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Vps8Q0P5W1 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Vps8Q0P5W1 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Vps8Q0P5W1 Gm29787-201ENSMUST00000222129 849 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Vps8Q0P5W1 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Vps8Q0P5W1 Gm14267-206ENSMUST00000226870 1209 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Vps8Q0P5W1 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Vps8Q0P5W1 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Vps8Q0P5W1 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Vps8Q0P5W1 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Vps8Q0P5W1 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vps8Q0P5W1 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vps8Q0P5W1 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vps8Q0P5W1 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vps8Q0P5W1 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vps8Q0P5W1 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vps8Q0P5W1 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vps8Q0P5W1 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vps8Q0P5W1 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vps8Q0P5W1 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vps8Q0P5W1 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vps8Q0P5W1 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vps8Q0P5W1 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Vps8Q0P5W1 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vps8Q0P5W1 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vps8Q0P5W1 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Vps8Q0P5W1 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vps8Q0P5W1 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Vps8Q0P5W1 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Vps8Q0P5W1 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vps8Q0P5W1 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Vps8Q0P5W1 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vps8Q0P5W1 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vps8Q0P5W1 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vps8Q0P5W1 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vps8Q0P5W1 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vps8Q0P5W1 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vps8Q0P5W1 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vps8Q0P5W1 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vps8Q0P5W1 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vps8Q0P5W1 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vps8Q0P5W1 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vps8Q0P5W1 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vps8Q0P5W1 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vps8Q0P5W1 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vps8Q0P5W1 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vps8Q0P5W1 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vps8Q0P5W1 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vps8Q0P5W1 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vps8Q0P5W1 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vps8Q0P5W1 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Vps8Q0P5W1 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Vps8Q0P5W1 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vps8Q0P5W1 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vps8Q0P5W1 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vps8Q0P5W1 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vps8Q0P5W1 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vps8Q0P5W1 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vps8Q0P5W1 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vps8Q0P5W1 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vps8Q0P5W1 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vps8Q0P5W1 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vps8Q0P5W1 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vps8Q0P5W1 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vps8Q0P5W1 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Vps8Q0P5W1 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vps8Q0P5W1 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vps8Q0P5W1 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vps8Q0P5W1 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vps8Q0P5W1 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vps8Q0P5W1 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Vps8Q0P5W1 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vps8Q0P5W1 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vps8Q0P5W1 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vps8Q0P5W1 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vps8Q0P5W1 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vps8Q0P5W1 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vps8Q0P5W1 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vps8Q0P5W1 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vps8Q0P5W1 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Vps8Q0P5W1 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Vps8Q0P5W1 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Vps8Q0P5W1 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vps8Q0P5W1 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vps8Q0P5W1 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vps8Q0P5W1 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Vps8Q0P5W1 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms