Protein–RNA interactions for Protein: Q0HA38

Ttc21b, Tetratricopeptide repeat protein 21B, mousemouse

Predictions only

Length 1,315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21bQ0HA38 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ttc21bQ0HA38 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ttc21bQ0HA38 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Ttc21bQ0HA38 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ttc21bQ0HA38 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ttc21bQ0HA38 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ttc21bQ0HA38 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ttc21bQ0HA38 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ttc21bQ0HA38 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ttc21bQ0HA38 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ttc21bQ0HA38 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Ttc21bQ0HA38 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ttc21bQ0HA38 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ttc21bQ0HA38 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ttc21bQ0HA38 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ttc21bQ0HA38 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ttc21bQ0HA38 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ttc21bQ0HA38 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ttc21bQ0HA38 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ttc21bQ0HA38 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ttc21bQ0HA38 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ttc21bQ0HA38 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ttc21bQ0HA38 Gm11667-201ENSMUST00000119828 486 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Ttc21bQ0HA38 Rpl28-ps1-201ENSMUST00000121497 414 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Ttc21bQ0HA38 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Ttc21bQ0HA38 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ttc21bQ0HA38 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Ttc21bQ0HA38 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Ttc21bQ0HA38 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ttc21bQ0HA38 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Ttc21bQ0HA38 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Ttc21bQ0HA38 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Ttc21bQ0HA38 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ttc21bQ0HA38 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ttc21bQ0HA38 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ttc21bQ0HA38 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ttc21bQ0HA38 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ttc21bQ0HA38 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ttc21bQ0HA38 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ttc21bQ0HA38 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ttc21bQ0HA38 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ttc21bQ0HA38 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ttc21bQ0HA38 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ttc21bQ0HA38 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ttc21bQ0HA38 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ttc21bQ0HA38 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ttc21bQ0HA38 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ttc21bQ0HA38 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ttc21bQ0HA38 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ttc21bQ0HA38 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ttc21bQ0HA38 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ttc21bQ0HA38 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ttc21bQ0HA38 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ttc21bQ0HA38 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ttc21bQ0HA38 Wdr45-206ENSMUST00000116634 1250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ttc21bQ0HA38 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Ttc21bQ0HA38 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ttc21bQ0HA38 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Ttc21bQ0HA38 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ttc21bQ0HA38 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ttc21bQ0HA38 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Ttc21bQ0HA38 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ttc21bQ0HA38 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ttc21bQ0HA38 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ttc21bQ0HA38 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ttc21bQ0HA38 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ttc21bQ0HA38 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ttc21bQ0HA38 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ttc21bQ0HA38 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ttc21bQ0HA38 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ttc21bQ0HA38 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ttc21bQ0HA38 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ttc21bQ0HA38 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Ttc21bQ0HA38 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ttc21bQ0HA38 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ttc21bQ0HA38 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ttc21bQ0HA38 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ttc21bQ0HA38 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ttc21bQ0HA38 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ttc21bQ0HA38 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ttc21bQ0HA38 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ttc21bQ0HA38 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ttc21bQ0HA38 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ttc21bQ0HA38 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ttc21bQ0HA38 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ttc21bQ0HA38 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ttc21bQ0HA38 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ttc21bQ0HA38 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ttc21bQ0HA38 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Ttc21bQ0HA38 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Ttc21bQ0HA38 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ttc21bQ0HA38 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Ttc21bQ0HA38 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ttc21bQ0HA38 Gm10752-201ENSMUST00000218348 729 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Ttc21bQ0HA38 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ttc21bQ0HA38 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ttc21bQ0HA38 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ttc21bQ0HA38 Gm10179-201ENSMUST00000086233 688 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Ttc21bQ0HA38 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ttc21bQ0HA38 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.3 ms