Protein–RNA interactions for Protein: Q0GA42

Cnnm1, Metal transporter CNNM1, mousemouse

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnnm1Q0GA42 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cnnm1Q0GA42 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Cnnm1Q0GA42 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cnnm1Q0GA42 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Cnnm1Q0GA42 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cnnm1Q0GA42 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cnnm1Q0GA42 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cnnm1Q0GA42 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cnnm1Q0GA42 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cnnm1Q0GA42 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cnnm1Q0GA42 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cnnm1Q0GA42 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cnnm1Q0GA42 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cnnm1Q0GA42 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cnnm1Q0GA42 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cnnm1Q0GA42 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cnnm1Q0GA42 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cnnm1Q0GA42 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cnnm1Q0GA42 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cnnm1Q0GA42 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Cnnm1Q0GA42 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cnnm1Q0GA42 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cnnm1Q0GA42 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cnnm1Q0GA42 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cnnm1Q0GA42 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Cnnm1Q0GA42 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cnnm1Q0GA42 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cnnm1Q0GA42 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cnnm1Q0GA42 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cnnm1Q0GA42 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cnnm1Q0GA42 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cnnm1Q0GA42 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cnnm1Q0GA42 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cnnm1Q0GA42 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cnnm1Q0GA42 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cnnm1Q0GA42 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cnnm1Q0GA42 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cnnm1Q0GA42 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Cnnm1Q0GA42 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Cnnm1Q0GA42 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cnnm1Q0GA42 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cnnm1Q0GA42 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cnnm1Q0GA42 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cnnm1Q0GA42 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cnnm1Q0GA42 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Cnnm1Q0GA42 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cnnm1Q0GA42 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cnnm1Q0GA42 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cnnm1Q0GA42 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cnnm1Q0GA42 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cnnm1Q0GA42 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cnnm1Q0GA42 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cnnm1Q0GA42 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cnnm1Q0GA42 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cnnm1Q0GA42 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cnnm1Q0GA42 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cnnm1Q0GA42 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cnnm1Q0GA42 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cnnm1Q0GA42 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cnnm1Q0GA42 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cnnm1Q0GA42 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cnnm1Q0GA42 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cnnm1Q0GA42 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cnnm1Q0GA42 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cnnm1Q0GA42 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cnnm1Q0GA42 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cnnm1Q0GA42 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cnnm1Q0GA42 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cnnm1Q0GA42 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cnnm1Q0GA42 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cnnm1Q0GA42 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cnnm1Q0GA42 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cnnm1Q0GA42 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cnnm1Q0GA42 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cnnm1Q0GA42 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cnnm1Q0GA42 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cnnm1Q0GA42 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Cnnm1Q0GA42 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Cnnm1Q0GA42 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cnnm1Q0GA42 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cnnm1Q0GA42 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cnnm1Q0GA42 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Cnnm1Q0GA42 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cnnm1Q0GA42 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Cnnm1Q0GA42 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Cnnm1Q0GA42 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cnnm1Q0GA42 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cnnm1Q0GA42 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cnnm1Q0GA42 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cnnm1Q0GA42 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cnnm1Q0GA42 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cnnm1Q0GA42 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cnnm1Q0GA42 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cnnm1Q0GA42 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cnnm1Q0GA42 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cnnm1Q0GA42 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cnnm1Q0GA42 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnnm1Q0GA42 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnnm1Q0GA42 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnnm1Q0GA42 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.1 ms