Protein–RNA interactions for Protein: Q08331

Calb2, Calretinin, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calb2Q08331 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Calb2Q08331 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Calb2Q08331 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Calb2Q08331 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Calb2Q08331 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Calb2Q08331 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Calb2Q08331 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Calb2Q08331 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Calb2Q08331 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Calb2Q08331 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Calb2Q08331 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Calb2Q08331 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Calb2Q08331 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Calb2Q08331 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Calb2Q08331 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Calb2Q08331 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Calb2Q08331 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Calb2Q08331 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Calb2Q08331 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Calb2Q08331 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Calb2Q08331 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Calb2Q08331 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Calb2Q08331 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Calb2Q08331 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Calb2Q08331 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Calb2Q08331 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Calb2Q08331 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Calb2Q08331 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Calb2Q08331 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Calb2Q08331 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Calb2Q08331 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Calb2Q08331 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Calb2Q08331 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Calb2Q08331 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Calb2Q08331 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Calb2Q08331 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Calb2Q08331 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Calb2Q08331 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Calb2Q08331 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Calb2Q08331 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Calb2Q08331 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Calb2Q08331 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Calb2Q08331 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Calb2Q08331 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Calb2Q08331 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Calb2Q08331 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Calb2Q08331 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Calb2Q08331 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Calb2Q08331 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Calb2Q08331 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Calb2Q08331 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Calb2Q08331 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Calb2Q08331 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Calb2Q08331 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Calb2Q08331 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Calb2Q08331 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Calb2Q08331 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.39
Calb2Q08331 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.39
Calb2Q08331 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Calb2Q08331 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.39
Calb2Q08331 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.39
Calb2Q08331 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Calb2Q08331 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Calb2Q08331 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Calb2Q08331 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Calb2Q08331 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Calb2Q08331 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Calb2Q08331 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Calb2Q08331 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Calb2Q08331 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Calb2Q08331 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Calb2Q08331 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Calb2Q08331 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Calb2Q08331 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Calb2Q08331 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Calb2Q08331 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Calb2Q08331 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Calb2Q08331 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Calb2Q08331 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Calb2Q08331 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Calb2Q08331 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Calb2Q08331 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Calb2Q08331 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Calb2Q08331 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Calb2Q08331 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Calb2Q08331 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Calb2Q08331 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Calb2Q08331 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Calb2Q08331 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Calb2Q08331 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Calb2Q08331 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Calb2Q08331 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Calb2Q08331 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Calb2Q08331 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Calb2Q08331 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Calb2Q08331 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Calb2Q08331 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Calb2Q08331 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Calb2Q08331 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Calb2Q08331 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.5 ms