Protein–RNA interactions for Protein: Q08091

Cnn1, Calponin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn1Q08091 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cnn1Q08091 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cnn1Q08091 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cnn1Q08091 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cnn1Q08091 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cnn1Q08091 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cnn1Q08091 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cnn1Q08091 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cnn1Q08091 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cnn1Q08091 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cnn1Q08091 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cnn1Q08091 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cnn1Q08091 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cnn1Q08091 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cnn1Q08091 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cnn1Q08091 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cnn1Q08091 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cnn1Q08091 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cnn1Q08091 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cnn1Q08091 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cnn1Q08091 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cnn1Q08091 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cnn1Q08091 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cnn1Q08091 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cnn1Q08091 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cnn1Q08091 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cnn1Q08091 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cnn1Q08091 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Cnn1Q08091 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cnn1Q08091 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cnn1Q08091 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cnn1Q08091 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cnn1Q08091 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cnn1Q08091 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cnn1Q08091 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cnn1Q08091 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cnn1Q08091 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cnn1Q08091 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cnn1Q08091 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cnn1Q08091 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cnn1Q08091 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Cnn1Q08091 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cnn1Q08091 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cnn1Q08091 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cnn1Q08091 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cnn1Q08091 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cnn1Q08091 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cnn1Q08091 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cnn1Q08091 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cnn1Q08091 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cnn1Q08091 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cnn1Q08091 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cnn1Q08091 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cnn1Q08091 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cnn1Q08091 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cnn1Q08091 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Cnn1Q08091 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cnn1Q08091 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cnn1Q08091 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cnn1Q08091 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cnn1Q08091 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cnn1Q08091 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cnn1Q08091 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cnn1Q08091 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cnn1Q08091 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cnn1Q08091 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cnn1Q08091 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cnn1Q08091 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cnn1Q08091 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cnn1Q08091 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cnn1Q08091 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cnn1Q08091 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cnn1Q08091 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cnn1Q08091 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cnn1Q08091 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cnn1Q08091 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cnn1Q08091 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cnn1Q08091 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cnn1Q08091 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cnn1Q08091 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cnn1Q08091 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cnn1Q08091 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cnn1Q08091 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cnn1Q08091 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cnn1Q08091 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cnn1Q08091 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cnn1Q08091 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cnn1Q08091 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cnn1Q08091 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cnn1Q08091 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cnn1Q08091 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cnn1Q08091 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cnn1Q08091 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Cnn1Q08091 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Cnn1Q08091 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cnn1Q08091 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cnn1Q08091 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cnn1Q08091 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cnn1Q08091 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cnn1Q08091 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
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