Protein–RNA interactions for Protein: Q04890

Sox12, Transcription factor SOX-12, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox12Q04890 Mdga2-212ENSMUST00000222987 1388 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sox12Q04890 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Sox12Q04890 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sox12Q04890 Gm27225-201ENSMUST00000183833 557 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Sox12Q04890 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Sox12Q04890 Ccl12-201ENSMUST00000000194 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sox12Q04890 Gm19030-201ENSMUST00000194947 552 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Sox12Q04890 Gm31752-201ENSMUST00000199456 856 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sox12Q04890 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sox12Q04890 Gm43761-201ENSMUST00000202132 991 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Sox12Q04890 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sox12Q04890 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sox12Q04890 Gm44760-201ENSMUST00000206375 1173 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Sox12Q04890 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sox12Q04890 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sox12Q04890 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sox12Q04890 AL929417.1-201ENSMUST00000214901 124 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Sox12Q04890 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Sox12Q04890 AC153646.1-201ENSMUST00000223229 1279 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Sox12Q04890 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sox12Q04890 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sox12Q04890 Olfr354-201ENSMUST00000068475 1084 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sox12Q04890 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sox12Q04890 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sox12Q04890 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sox12Q04890 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sox12Q04890 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sox12Q04890 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sox12Q04890 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sox12Q04890 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sox12Q04890 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sox12Q04890 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sox12Q04890 4930408K08Rik-201ENSMUST00000195936 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sox12Q04890 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sox12Q04890 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sox12Q04890 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sox12Q04890 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sox12Q04890 Gm28819-202ENSMUST00000187416 1335 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sox12Q04890 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sox12Q04890 AC160863.4-201ENSMUST00000218099 1334 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sox12Q04890 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sox12Q04890 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sox12Q04890 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sox12Q04890 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sox12Q04890 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sox12Q04890 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sox12Q04890 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sox12Q04890 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sox12Q04890 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sox12Q04890 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sox12Q04890 Gm10375-201ENSMUST00000100692 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sox12Q04890 Gm10377-201ENSMUST00000100695 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sox12Q04890 Gm3543-201ENSMUST00000111870 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sox12Q04890 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sox12Q04890 Gm12461-201ENSMUST00000120231 1239 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Sox12Q04890 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Sox12Q04890 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Sox12Q04890 Apol7d-203ENSMUST00000126516 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sox12Q04890 Gm24111-201ENSMUST00000175491 97 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Sox12Q04890 1700001F09Rik-201ENSMUST00000178178 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sox12Q04890 Gm28962-201ENSMUST00000187993 621 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sox12Q04890 Gm28692-202ENSMUST00000189645 621 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sox12Q04890 Gm38233-201ENSMUST00000194259 807 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Sox12Q04890 Gm37740-202ENSMUST00000194757 621 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sox12Q04890 Gm32554-201ENSMUST00000196310 970 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sox12Q04890 1700108N06Rik-201ENSMUST00000196572 681 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sox12Q04890 4930437M23Rik-201ENSMUST00000197456 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sox12Q04890 Gm43358-201ENSMUST00000199217 970 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sox12Q04890 Gm43131-201ENSMUST00000200042 969 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sox12Q04890 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sox12Q04890 AC161453.1-201ENSMUST00000226078 884 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sox12Q04890 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sox12Q04890 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sox12Q04890 AU016765-201ENSMUST00000097295 946 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sox12Q04890 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sox12Q04890 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sox12Q04890 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sox12Q04890 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sox12Q04890 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sox12Q04890 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sox12Q04890 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sox12Q04890 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sox12Q04890 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Sox12Q04890 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Sox12Q04890 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Sox12Q04890 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sox12Q04890 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sox12Q04890 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sox12Q04890 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sox12Q04890 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sox12Q04890 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sox12Q04890 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sox12Q04890 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sox12Q04890 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sox12Q04890 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Sox12Q04890 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sox12Q04890 Gm6461-201ENSMUST00000120015 633 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Sox12Q04890 Olfr1081-ps1-201ENSMUST00000120210 945 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Sox12Q04890 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sox12Q04890 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.4 ms