Protein–RNA interactions for Protein: Q03142

Fgfr4, Fibroblast growth factor receptor 4, mousemouse

Predictions only

Length 799 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgfr4Q03142 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Fgfr4Q03142 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Fgfr4Q03142 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Fgfr4Q03142 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Fgfr4Q03142 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Fgfr4Q03142 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Fgfr4Q03142 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Fgfr4Q03142 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Fgfr4Q03142 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Fgfr4Q03142 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Fgfr4Q03142 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Fgfr4Q03142 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Fgfr4Q03142 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Fgfr4Q03142 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC14.02□□□□□ -0.16
Fgfr4Q03142 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Fgfr4Q03142 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Fgfr4Q03142 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Fgfr4Q03142 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Fgfr4Q03142 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Fgfr4Q03142 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Fgfr4Q03142 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Fgfr4Q03142 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Fgfr4Q03142 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Fgfr4Q03142 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Fgfr4Q03142 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Fgfr4Q03142 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Fgfr4Q03142 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Fgfr4Q03142 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Fgfr4Q03142 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Fgfr4Q03142 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Fgfr4Q03142 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Fgfr4Q03142 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Fgfr4Q03142 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Fgfr4Q03142 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Fgfr4Q03142 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Fgfr4Q03142 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Fgfr4Q03142 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Fgfr4Q03142 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Fgfr4Q03142 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Fgfr4Q03142 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Fgfr4Q03142 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Fgfr4Q03142 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Fgfr4Q03142 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Fgfr4Q03142 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Fgfr4Q03142 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Fgfr4Q03142 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Fgfr4Q03142 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Fgfr4Q03142 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Fgfr4Q03142 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Fgfr4Q03142 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Fgfr4Q03142 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Fgfr4Q03142 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Fgfr4Q03142 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Fgfr4Q03142 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Fgfr4Q03142 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Fgfr4Q03142 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Fgfr4Q03142 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Fgfr4Q03142 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Fgfr4Q03142 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Fgfr4Q03142 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Fgfr4Q03142 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Fgfr4Q03142 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Fgfr4Q03142 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Fgfr4Q03142 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Fgfr4Q03142 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Fgfr4Q03142 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Fgfr4Q03142 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Fgfr4Q03142 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Fgfr4Q03142 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Fgfr4Q03142 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Fgfr4Q03142 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Fgfr4Q03142 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Fgfr4Q03142 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Fgfr4Q03142 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Fgfr4Q03142 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Fgfr4Q03142 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Fgfr4Q03142 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Fgfr4Q03142 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Fgfr4Q03142 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Fgfr4Q03142 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Fgfr4Q03142 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Fgfr4Q03142 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Fgfr4Q03142 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Fgfr4Q03142 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Fgfr4Q03142 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Fgfr4Q03142 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Fgfr4Q03142 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Fgfr4Q03142 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Fgfr4Q03142 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Fgfr4Q03142 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Fgfr4Q03142 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Fgfr4Q03142 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Fgfr4Q03142 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Fgfr4Q03142 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Fgfr4Q03142 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Fgfr4Q03142 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Fgfr4Q03142 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Fgfr4Q03142 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
Fgfr4Q03142 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Fgfr4Q03142 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms