Protein–RNA interactions for Protein: Q02591

Gsc, Homeobox protein goosecoid, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GscQ02591 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
GscQ02591 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
GscQ02591 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
GscQ02591 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
GscQ02591 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
GscQ02591 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
GscQ02591 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
GscQ02591 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
GscQ02591 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
GscQ02591 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
GscQ02591 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
GscQ02591 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
GscQ02591 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
GscQ02591 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
GscQ02591 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
GscQ02591 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
GscQ02591 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
GscQ02591 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
GscQ02591 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
GscQ02591 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
GscQ02591 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
GscQ02591 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
GscQ02591 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
GscQ02591 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
GscQ02591 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
GscQ02591 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
GscQ02591 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
GscQ02591 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
GscQ02591 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
GscQ02591 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
GscQ02591 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
GscQ02591 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
GscQ02591 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
GscQ02591 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
GscQ02591 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
GscQ02591 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
GscQ02591 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
GscQ02591 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
GscQ02591 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
GscQ02591 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
GscQ02591 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
GscQ02591 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
GscQ02591 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
GscQ02591 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
GscQ02591 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
GscQ02591 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
GscQ02591 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
GscQ02591 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
GscQ02591 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
GscQ02591 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
GscQ02591 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
GscQ02591 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
GscQ02591 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
GscQ02591 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
GscQ02591 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
GscQ02591 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
GscQ02591 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
GscQ02591 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
GscQ02591 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
GscQ02591 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
GscQ02591 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
GscQ02591 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
GscQ02591 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
GscQ02591 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
GscQ02591 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
GscQ02591 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
GscQ02591 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
GscQ02591 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
GscQ02591 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
GscQ02591 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
GscQ02591 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
GscQ02591 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
GscQ02591 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
GscQ02591 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
GscQ02591 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
GscQ02591 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
GscQ02591 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
GscQ02591 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
GscQ02591 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
GscQ02591 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
GscQ02591 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
GscQ02591 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
GscQ02591 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
GscQ02591 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
GscQ02591 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
GscQ02591 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
GscQ02591 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
GscQ02591 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
GscQ02591 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
GscQ02591 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
GscQ02591 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
GscQ02591 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
GscQ02591 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
GscQ02591 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
GscQ02591 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
GscQ02591 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
GscQ02591 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
GscQ02591 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
GscQ02591 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
GscQ02591 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms