Protein–RNA interactions for Protein: Q02248

Ctnnb1, Catenin beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 781 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnb1Q02248 Ighv1-52-201ENSMUST00000103522 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ctnnb1Q02248 Ndufs5-203ENSMUST00000106207 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ctnnb1Q02248 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ctnnb1Q02248 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Ctnnb1Q02248 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Ctnnb1Q02248 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Ctnnb1Q02248 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Ctnnb1Q02248 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Ctnnb1Q02248 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ctnnb1Q02248 Gm11831-201ENSMUST00000141538 629 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ctnnb1Q02248 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ctnnb1Q02248 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Ctnnb1Q02248 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Ctnnb1Q02248 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ctnnb1Q02248 Gm5051-201ENSMUST00000204085 485 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Ctnnb1Q02248 Ndufs5-201ENSMUST00000030401 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ctnnb1Q02248 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ctnnb1Q02248 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ctnnb1Q02248 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ctnnb1Q02248 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ctnnb1Q02248 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ctnnb1Q02248 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ctnnb1Q02248 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Ctnnb1Q02248 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ctnnb1Q02248 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ctnnb1Q02248 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ctnnb1Q02248 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ctnnb1Q02248 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ctnnb1Q02248 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ctnnb1Q02248 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ctnnb1Q02248 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ctnnb1Q02248 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ctnnb1Q02248 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ctnnb1Q02248 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ctnnb1Q02248 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ctnnb1Q02248 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ctnnb1Q02248 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ctnnb1Q02248 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ctnnb1Q02248 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ctnnb1Q02248 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ctnnb1Q02248 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Ctnnb1Q02248 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Ctnnb1Q02248 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ctnnb1Q02248 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ctnnb1Q02248 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ctnnb1Q02248 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ctnnb1Q02248 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ctnnb1Q02248 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ctnnb1Q02248 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ctnnb1Q02248 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ctnnb1Q02248 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ctnnb1Q02248 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ctnnb1Q02248 Gm13010-201ENSMUST00000140495 828 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ctnnb1Q02248 Gm14291-201ENSMUST00000143645 804 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ctnnb1Q02248 Gm16036-201ENSMUST00000150385 1112 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ctnnb1Q02248 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ctnnb1Q02248 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Ctnnb1Q02248 Gm27438-201ENSMUST00000183480 110 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Ctnnb1Q02248 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Ctnnb1Q02248 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ctnnb1Q02248 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Ctnnb1Q02248 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Ctnnb1Q02248 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ctnnb1Q02248 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ctnnb1Q02248 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ctnnb1Q02248 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ctnnb1Q02248 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ctnnb1Q02248 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ctnnb1Q02248 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ctnnb1Q02248 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ctnnb1Q02248 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ctnnb1Q02248 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ctnnb1Q02248 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ctnnb1Q02248 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ctnnb1Q02248 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ctnnb1Q02248 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ctnnb1Q02248 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ctnnb1Q02248 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ctnnb1Q02248 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ctnnb1Q02248 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Ctnnb1Q02248 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Ctnnb1Q02248 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Ctnnb1Q02248 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Ctnnb1Q02248 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Ctnnb1Q02248 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ctnnb1Q02248 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ctnnb1Q02248 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ctnnb1Q02248 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ctnnb1Q02248 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ctnnb1Q02248 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ctnnb1Q02248 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ctnnb1Q02248 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ctnnb1Q02248 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ctnnb1Q02248 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ctnnb1Q02248 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ctnnb1Q02248 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ctnnb1Q02248 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Ctnnb1Q02248 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Ctnnb1Q02248 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ctnnb1Q02248 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms