Protein–RNA interactions for Protein: Q01279

Egfr, Epidermal growth factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EgfrQ01279 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EgfrQ01279 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EgfrQ01279 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EgfrQ01279 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EgfrQ01279 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EgfrQ01279 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EgfrQ01279 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EgfrQ01279 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EgfrQ01279 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EgfrQ01279 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
EgfrQ01279 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EgfrQ01279 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EgfrQ01279 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EgfrQ01279 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EgfrQ01279 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EgfrQ01279 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EgfrQ01279 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EgfrQ01279 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EgfrQ01279 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EgfrQ01279 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EgfrQ01279 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EgfrQ01279 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EgfrQ01279 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EgfrQ01279 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EgfrQ01279 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EgfrQ01279 Gm11340-201ENSMUST00000119226 412 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
EgfrQ01279 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
EgfrQ01279 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EgfrQ01279 B230119M05Rik-201ENSMUST00000154072 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EgfrQ01279 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EgfrQ01279 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
EgfrQ01279 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EgfrQ01279 Olfr567-ps1-201ENSMUST00000210349 857 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
EgfrQ01279 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EgfrQ01279 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EgfrQ01279 Gm4950-201ENSMUST00000091905 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EgfrQ01279 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EgfrQ01279 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EgfrQ01279 Rab30-202ENSMUST00000107179 1304 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EgfrQ01279 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
EgfrQ01279 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
EgfrQ01279 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EgfrQ01279 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EgfrQ01279 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EgfrQ01279 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EgfrQ01279 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EgfrQ01279 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EgfrQ01279 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EgfrQ01279 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EgfrQ01279 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EgfrQ01279 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EgfrQ01279 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EgfrQ01279 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EgfrQ01279 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EgfrQ01279 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EgfrQ01279 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EgfrQ01279 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EgfrQ01279 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EgfrQ01279 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EgfrQ01279 Tprkb-203ENSMUST00000113751 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EgfrQ01279 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
EgfrQ01279 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
EgfrQ01279 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
EgfrQ01279 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
EgfrQ01279 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EgfrQ01279 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EgfrQ01279 Gm35822-201ENSMUST00000204954 562 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EgfrQ01279 Gm6145-204ENSMUST00000210902 1266 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EgfrQ01279 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EgfrQ01279 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
EgfrQ01279 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EgfrQ01279 Nop10-201ENSMUST00000028553 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EgfrQ01279 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EgfrQ01279 Rdh16f2-201ENSMUST00000092058 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EgfrQ01279 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
EgfrQ01279 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EgfrQ01279 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EgfrQ01279 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EgfrQ01279 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EgfrQ01279 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EgfrQ01279 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EgfrQ01279 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EgfrQ01279 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EgfrQ01279 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EgfrQ01279 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EgfrQ01279 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EgfrQ01279 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EgfrQ01279 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EgfrQ01279 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EgfrQ01279 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EgfrQ01279 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EgfrQ01279 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EgfrQ01279 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EgfrQ01279 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EgfrQ01279 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EgfrQ01279 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EgfrQ01279 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EgfrQ01279 Gm13047-201ENSMUST00000117116 815 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
EgfrQ01279 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EgfrQ01279 Prss46-201ENSMUST00000119427 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms