Protein–RNA interactions for Protein: Q01098

Grin2c, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2C, mousemouse

Predictions only

Length 1,239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2cQ01098 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Grin2cQ01098 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Grin2cQ01098 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Grin2cQ01098 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Grin2cQ01098 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Grin2cQ01098 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Grin2cQ01098 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Grin2cQ01098 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Grin2cQ01098 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Grin2cQ01098 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Grin2cQ01098 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Grin2cQ01098 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Grin2cQ01098 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Grin2cQ01098 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Grin2cQ01098 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Grin2cQ01098 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Grin2cQ01098 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Grin2cQ01098 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Grin2cQ01098 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Grin2cQ01098 Gm12208-201ENSMUST00000122004 163 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Grin2cQ01098 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Grin2cQ01098 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Grin2cQ01098 Higd1c-201ENSMUST00000175683 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Grin2cQ01098 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Grin2cQ01098 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Grin2cQ01098 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Grin2cQ01098 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Grin2cQ01098 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Grin2cQ01098 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Grin2cQ01098 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Grin2cQ01098 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Grin2cQ01098 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Grin2cQ01098 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Grin2cQ01098 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Grin2cQ01098 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Grin2cQ01098 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Grin2cQ01098 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Grin2cQ01098 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Grin2cQ01098 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Grin2cQ01098 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Grin2cQ01098 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Grin2cQ01098 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Grin2cQ01098 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Grin2cQ01098 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Grin2cQ01098 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Grin2cQ01098 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Grin2cQ01098 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Grin2cQ01098 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Grin2cQ01098 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Grin2cQ01098 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Grin2cQ01098 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Grin2cQ01098 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Grin2cQ01098 EU599041-202ENSMUST00000205291 1386 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Grin2cQ01098 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Grin2cQ01098 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Grin2cQ01098 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Grin2cQ01098 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Grin2cQ01098 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Grin2cQ01098 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Grin2cQ01098 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Grin2cQ01098 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Grin2cQ01098 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Grin2cQ01098 Cdk5rap1-202ENSMUST00000109730 1227 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Grin2cQ01098 Gm14542-201ENSMUST00000118460 1248 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Grin2cQ01098 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Grin2cQ01098 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Grin2cQ01098 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Grin2cQ01098 Gm28727-201ENSMUST00000176549 443 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Grin2cQ01098 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Grin2cQ01098 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Grin2cQ01098 Gm26952-201ENSMUST00000181996 409 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Grin2cQ01098 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Grin2cQ01098 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Grin2cQ01098 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Grin2cQ01098 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Grin2cQ01098 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Grin2cQ01098 Gm18363-201ENSMUST00000221671 730 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Grin2cQ01098 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Grin2cQ01098 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Grin2cQ01098 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Grin2cQ01098 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Grin2cQ01098 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Grin2cQ01098 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Grin2cQ01098 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Grin2cQ01098 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Grin2cQ01098 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Grin2cQ01098 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Grin2cQ01098 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Grin2cQ01098 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Grin2cQ01098 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Grin2cQ01098 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Grin2cQ01098 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Grin2cQ01098 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Grin2cQ01098 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Grin2cQ01098 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Grin2cQ01098 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Grin2cQ01098 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Grin2cQ01098 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Grin2cQ01098 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Grin2cQ01098 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.8 ms