Protein–RNA interactions for Protein: Q01097

Grin2b, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, mousemouse

Predictions only

Length 1,482 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2bQ01097 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Grin2bQ01097 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Grin2bQ01097 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Grin2bQ01097 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Grin2bQ01097 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Grin2bQ01097 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Grin2bQ01097 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Grin2bQ01097 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Grin2bQ01097 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Grin2bQ01097 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Grin2bQ01097 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Grin2bQ01097 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Grin2bQ01097 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Grin2bQ01097 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Grin2bQ01097 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Grin2bQ01097 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Grin2bQ01097 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Grin2bQ01097 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Grin2bQ01097 2610005L07Rik-201ENSMUST00000139264 948 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Grin2bQ01097 Gm13703-201ENSMUST00000150705 449 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Grin2bQ01097 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Grin2bQ01097 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Grin2bQ01097 Gm6485-201ENSMUST00000160676 439 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Grin2bQ01097 Hmgn3-201ENSMUST00000161796 862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Grin2bQ01097 Gm25072-201ENSMUST00000175233 235 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Grin2bQ01097 Gm21092-201ENSMUST00000178995 955 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Grin2bQ01097 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Grin2bQ01097 Gm37419-201ENSMUST00000210705 114 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Grin2bQ01097 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Grin2bQ01097 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Grin2bQ01097 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Grin2bQ01097 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Grin2bQ01097 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Grin2bQ01097 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Grin2bQ01097 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Grin2bQ01097 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Grin2bQ01097 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Grin2bQ01097 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Grin2bQ01097 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Grin2bQ01097 Gm16323-201ENSMUST00000134920 556 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Grin2bQ01097 Tmem40-206ENSMUST00000170625 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Grin2bQ01097 Rn7s6-201ENSMUST00000175005 291 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Grin2bQ01097 Gm23045-201ENSMUST00000175041 96 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Grin2bQ01097 Gadd45a-206ENSMUST00000204282 460 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Grin2bQ01097 Gm45338-201ENSMUST00000209198 820 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Grin2bQ01097 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Grin2bQ01097 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Grin2bQ01097 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Grin2bQ01097 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Grin2bQ01097 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Grin2bQ01097 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Grin2bQ01097 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Grin2bQ01097 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Grin2bQ01097 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Grin2bQ01097 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Grin2bQ01097 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Grin2bQ01097 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Grin2bQ01097 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Grin2bQ01097 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Grin2bQ01097 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Grin2bQ01097 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Grin2bQ01097 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Grin2bQ01097 Tbcel-206ENSMUST00000138506 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Grin2bQ01097 Gm28037-201ENSMUST00000122365 611 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Grin2bQ01097 Itpr3os-201ENSMUST00000143605 794 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Grin2bQ01097 Gm18159-201ENSMUST00000174516 1070 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Grin2bQ01097 Gm28388-201ENSMUST00000186262 437 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Grin2bQ01097 Gm37028-201ENSMUST00000194276 107 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Grin2bQ01097 Gm43186-201ENSMUST00000198130 824 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Grin2bQ01097 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Grin2bQ01097 Gm44270-201ENSMUST00000203084 1234 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Grin2bQ01097 AC174797.2-202ENSMUST00000225729 568 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Grin2bQ01097 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Grin2bQ01097 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Grin2bQ01097 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Grin2bQ01097 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Grin2bQ01097 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Grin2bQ01097 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Grin2bQ01097 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Grin2bQ01097 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Grin2bQ01097 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Grin2bQ01097 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Grin2bQ01097 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Grin2bQ01097 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Grin2bQ01097 n-R5s64-201ENSMUST00000102019 119 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Grin2bQ01097 Pmp22-202ENSMUST00000108700 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Grin2bQ01097 Sumo2-203ENSMUST00000117589 987 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Grin2bQ01097 Gm11956-201ENSMUST00000119525 512 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Grin2bQ01097 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Grin2bQ01097 Dmrtc1a-204ENSMUST00000121197 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Grin2bQ01097 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Grin2bQ01097 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Grin2bQ01097 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Grin2bQ01097 Gm44329-201ENSMUST00000197469 112 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Grin2bQ01097 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Grin2bQ01097 Snu13-202ENSMUST00000080622 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Grin2bQ01097 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Grin2bQ01097 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Grin2bQ01097 Gm12248-202ENSMUST00000218429 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Grin2bQ01097 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms