Protein–RNA interactions for Protein: Q00977

Gjb2, Gap junction beta-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb2Q00977 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gjb2Q00977 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gjb2Q00977 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gjb2Q00977 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gjb2Q00977 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gjb2Q00977 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gjb2Q00977 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gjb2Q00977 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gjb2Q00977 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gjb2Q00977 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gjb2Q00977 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gjb2Q00977 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gjb2Q00977 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gjb2Q00977 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gjb2Q00977 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gjb2Q00977 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gjb2Q00977 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gjb2Q00977 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gjb2Q00977 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gjb2Q00977 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gjb2Q00977 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gjb2Q00977 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gjb2Q00977 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gjb2Q00977 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gjb2Q00977 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gjb2Q00977 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gjb2Q00977 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gjb2Q00977 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gjb2Q00977 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gjb2Q00977 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gjb2Q00977 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gjb2Q00977 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gjb2Q00977 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gjb2Q00977 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gjb2Q00977 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gjb2Q00977 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gjb2Q00977 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gjb2Q00977 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gjb2Q00977 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gjb2Q00977 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gjb2Q00977 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gjb2Q00977 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gjb2Q00977 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gjb2Q00977 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gjb2Q00977 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gjb2Q00977 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gjb2Q00977 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gjb2Q00977 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gjb2Q00977 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gjb2Q00977 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gjb2Q00977 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gjb2Q00977 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gjb2Q00977 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gjb2Q00977 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gjb2Q00977 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gjb2Q00977 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gjb2Q00977 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gjb2Q00977 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gjb2Q00977 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gjb2Q00977 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gjb2Q00977 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gjb2Q00977 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gjb2Q00977 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gjb2Q00977 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gjb2Q00977 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gjb2Q00977 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gjb2Q00977 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gjb2Q00977 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gjb2Q00977 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gjb2Q00977 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gjb2Q00977 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gjb2Q00977 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gjb2Q00977 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Gjb2Q00977 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gjb2Q00977 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gjb2Q00977 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gjb2Q00977 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gjb2Q00977 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gjb2Q00977 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gjb2Q00977 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gjb2Q00977 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gjb2Q00977 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Gjb2Q00977 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gjb2Q00977 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gjb2Q00977 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gjb2Q00977 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gjb2Q00977 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gjb2Q00977 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gjb2Q00977 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gjb2Q00977 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gjb2Q00977 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gjb2Q00977 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gjb2Q00977 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gjb2Q00977 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gjb2Q00977 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gjb2Q00977 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gjb2Q00977 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gjb2Q00977 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Gjb2Q00977 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gjb2Q00977 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms