Protein–RNA interactions for Protein: Q00724

Rbp4, Retinol-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp4Q00724 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rbp4Q00724 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rbp4Q00724 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rbp4Q00724 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rbp4Q00724 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rbp4Q00724 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rbp4Q00724 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rbp4Q00724 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rbp4Q00724 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rbp4Q00724 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rbp4Q00724 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rbp4Q00724 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rbp4Q00724 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rbp4Q00724 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rbp4Q00724 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rbp4Q00724 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rbp4Q00724 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rbp4Q00724 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rbp4Q00724 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rbp4Q00724 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rbp4Q00724 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Rbp4Q00724 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rbp4Q00724 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rbp4Q00724 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rbp4Q00724 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rbp4Q00724 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rbp4Q00724 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rbp4Q00724 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rbp4Q00724 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rbp4Q00724 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rbp4Q00724 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rbp4Q00724 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rbp4Q00724 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Rbp4Q00724 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Rbp4Q00724 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rbp4Q00724 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rbp4Q00724 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rbp4Q00724 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Rbp4Q00724 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rbp4Q00724 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rbp4Q00724 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rbp4Q00724 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Rbp4Q00724 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rbp4Q00724 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rbp4Q00724 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rbp4Q00724 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rbp4Q00724 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rbp4Q00724 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rbp4Q00724 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rbp4Q00724 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rbp4Q00724 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Rbp4Q00724 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Rbp4Q00724 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Rbp4Q00724 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Rbp4Q00724 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Rbp4Q00724 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Rbp4Q00724 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Rbp4Q00724 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Rbp4Q00724 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Rbp4Q00724 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Rbp4Q00724 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rbp4Q00724 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rbp4Q00724 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rbp4Q00724 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rbp4Q00724 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rbp4Q00724 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rbp4Q00724 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rbp4Q00724 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Rbp4Q00724 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rbp4Q00724 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rbp4Q00724 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rbp4Q00724 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rbp4Q00724 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Rbp4Q00724 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rbp4Q00724 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rbp4Q00724 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rbp4Q00724 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rbp4Q00724 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rbp4Q00724 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rbp4Q00724 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rbp4Q00724 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rbp4Q00724 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rbp4Q00724 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rbp4Q00724 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rbp4Q00724 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rbp4Q00724 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rbp4Q00724 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rbp4Q00724 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rbp4Q00724 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rbp4Q00724 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Rbp4Q00724 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rbp4Q00724 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rbp4Q00724 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rbp4Q00724 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rbp4Q00724 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rbp4Q00724 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rbp4Q00724 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rbp4Q00724 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rbp4Q00724 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rbp4Q00724 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms