Protein–RNA interactions for Protein: Q00623

Apoa1, Apolipoprotein A-I, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa1Q00623 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Apoa1Q00623 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Apoa1Q00623 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Apoa1Q00623 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Apoa1Q00623 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Apoa1Q00623 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Apoa1Q00623 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Apoa1Q00623 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Apoa1Q00623 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Apoa1Q00623 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Apoa1Q00623 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Apoa1Q00623 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Apoa1Q00623 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Apoa1Q00623 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Apoa1Q00623 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Apoa1Q00623 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Apoa1Q00623 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Apoa1Q00623 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Apoa1Q00623 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Apoa1Q00623 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Apoa1Q00623 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Apoa1Q00623 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Apoa1Q00623 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Apoa1Q00623 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Apoa1Q00623 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Apoa1Q00623 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Apoa1Q00623 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Apoa1Q00623 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Apoa1Q00623 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Apoa1Q00623 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Apoa1Q00623 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Apoa1Q00623 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Apoa1Q00623 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Apoa1Q00623 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Apoa1Q00623 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Apoa1Q00623 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Apoa1Q00623 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Apoa1Q00623 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Apoa1Q00623 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Apoa1Q00623 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Apoa1Q00623 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Apoa1Q00623 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Apoa1Q00623 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Apoa1Q00623 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Apoa1Q00623 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Apoa1Q00623 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Apoa1Q00623 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Apoa1Q00623 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Apoa1Q00623 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Apoa1Q00623 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Apoa1Q00623 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Apoa1Q00623 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Apoa1Q00623 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Apoa1Q00623 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Apoa1Q00623 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Apoa1Q00623 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Apoa1Q00623 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Apoa1Q00623 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Apoa1Q00623 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Apoa1Q00623 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Apoa1Q00623 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Apoa1Q00623 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Apoa1Q00623 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Apoa1Q00623 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Apoa1Q00623 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Apoa1Q00623 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Apoa1Q00623 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Apoa1Q00623 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Apoa1Q00623 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Apoa1Q00623 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Apoa1Q00623 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Apoa1Q00623 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Apoa1Q00623 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Apoa1Q00623 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Apoa1Q00623 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Apoa1Q00623 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Apoa1Q00623 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Apoa1Q00623 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Apoa1Q00623 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Apoa1Q00623 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Apoa1Q00623 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Apoa1Q00623 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Apoa1Q00623 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Apoa1Q00623 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Apoa1Q00623 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Apoa1Q00623 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Apoa1Q00623 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Apoa1Q00623 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Apoa1Q00623 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Apoa1Q00623 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Apoa1Q00623 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Apoa1Q00623 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Apoa1Q00623 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Apoa1Q00623 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Apoa1Q00623 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Apoa1Q00623 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Apoa1Q00623 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Apoa1Q00623 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Apoa1Q00623 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Apoa1Q00623 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms