Protein–RNA interactions for Protein: P97793

Alk, ALK tyrosine kinase receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AlkP97793 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
AlkP97793 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
AlkP97793 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
AlkP97793 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
AlkP97793 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
AlkP97793 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
AlkP97793 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
AlkP97793 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
AlkP97793 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
AlkP97793 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
AlkP97793 Ptbp2-210ENSMUST00000198403 389 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
AlkP97793 Olfr567-ps1-201ENSMUST00000210349 857 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
AlkP97793 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
AlkP97793 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
AlkP97793 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
AlkP97793 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
AlkP97793 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
AlkP97793 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
AlkP97793 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
AlkP97793 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
AlkP97793 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
AlkP97793 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
AlkP97793 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
AlkP97793 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
AlkP97793 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
AlkP97793 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
AlkP97793 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
AlkP97793 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
AlkP97793 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
AlkP97793 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
AlkP97793 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
AlkP97793 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
AlkP97793 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
AlkP97793 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
AlkP97793 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
AlkP97793 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
AlkP97793 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
AlkP97793 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
AlkP97793 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
AlkP97793 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
AlkP97793 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
AlkP97793 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
AlkP97793 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
AlkP97793 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
AlkP97793 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
AlkP97793 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
AlkP97793 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
AlkP97793 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
AlkP97793 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
AlkP97793 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
AlkP97793 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
AlkP97793 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
AlkP97793 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
AlkP97793 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
AlkP97793 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
AlkP97793 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
AlkP97793 Mrpl23-206ENSMUST00000210662 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
AlkP97793 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
AlkP97793 Nceh1-202ENSMUST00000091284 830 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
AlkP97793 Rsg1-201ENSMUST00000097813 985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
AlkP97793 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
AlkP97793 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
AlkP97793 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
AlkP97793 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
AlkP97793 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
AlkP97793 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
AlkP97793 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
AlkP97793 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
AlkP97793 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
AlkP97793 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
AlkP97793 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
AlkP97793 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
AlkP97793 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
AlkP97793 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
AlkP97793 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
AlkP97793 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
AlkP97793 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
AlkP97793 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
AlkP97793 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
AlkP97793 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
AlkP97793 Rps28-203ENSMUST00000173019 437 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
AlkP97793 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
AlkP97793 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
AlkP97793 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
AlkP97793 Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 548 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
AlkP97793 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
AlkP97793 AC174797.2-202ENSMUST00000225729 568 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
AlkP97793 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
AlkP97793 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
AlkP97793 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
AlkP97793 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
AlkP97793 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
AlkP97793 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
AlkP97793 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
AlkP97793 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
AlkP97793 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
AlkP97793 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
AlkP97793 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
AlkP97793 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
AlkP97793 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms