Protein–RNA interactions for Protein: P97496

Smarcc1, SWI/SNF complex subunit SMARCC1, mousemouse

Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcc1P97496 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Smarcc1P97496 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Smarcc1P97496 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Smarcc1P97496 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Smarcc1P97496 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Smarcc1P97496 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Smarcc1P97496 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Smarcc1P97496 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smarcc1P97496 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smarcc1P97496 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smarcc1P97496 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smarcc1P97496 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Smarcc1P97496 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smarcc1P97496 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smarcc1P97496 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smarcc1P97496 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smarcc1P97496 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smarcc1P97496 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smarcc1P97496 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Smarcc1P97496 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Smarcc1P97496 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smarcc1P97496 Gm11831-201ENSMUST00000141538 629 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smarcc1P97496 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smarcc1P97496 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smarcc1P97496 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smarcc1P97496 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smarcc1P97496 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smarcc1P97496 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Smarcc1P97496 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smarcc1P97496 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smarcc1P97496 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smarcc1P97496 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smarcc1P97496 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smarcc1P97496 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smarcc1P97496 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smarcc1P97496 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smarcc1P97496 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smarcc1P97496 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smarcc1P97496 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Smarcc1P97496 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smarcc1P97496 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smarcc1P97496 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smarcc1P97496 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smarcc1P97496 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smarcc1P97496 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smarcc1P97496 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smarcc1P97496 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smarcc1P97496 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smarcc1P97496 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smarcc1P97496 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Smarcc1P97496 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smarcc1P97496 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smarcc1P97496 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smarcc1P97496 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smarcc1P97496 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smarcc1P97496 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smarcc1P97496 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smarcc1P97496 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smarcc1P97496 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smarcc1P97496 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Smarcc1P97496 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Smarcc1P97496 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smarcc1P97496 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smarcc1P97496 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smarcc1P97496 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Smarcc1P97496 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smarcc1P97496 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smarcc1P97496 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Smarcc1P97496 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Smarcc1P97496 Gm13010-201ENSMUST00000140495 828 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Smarcc1P97496 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smarcc1P97496 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Smarcc1P97496 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Smarcc1P97496 Gm44126-201ENSMUST00000204831 514 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Smarcc1P97496 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Smarcc1P97496 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Smarcc1P97496 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Smarcc1P97496 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smarcc1P97496 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smarcc1P97496 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Smarcc1P97496 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smarcc1P97496 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Smarcc1P97496 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Smarcc1P97496 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Smarcc1P97496 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smarcc1P97496 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smarcc1P97496 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smarcc1P97496 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smarcc1P97496 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smarcc1P97496 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smarcc1P97496 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Smarcc1P97496 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smarcc1P97496 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smarcc1P97496 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smarcc1P97496 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smarcc1P97496 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smarcc1P97496 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smarcc1P97496 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smarcc1P97496 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smarcc1P97496 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.3 ms