Protein–RNA interactions for Protein: P97355

Sms, Spermine synthase, mousemouse

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Length 366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SmsP97355 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SmsP97355 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SmsP97355 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SmsP97355 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SmsP97355 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SmsP97355 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
SmsP97355 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SmsP97355 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SmsP97355 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SmsP97355 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SmsP97355 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SmsP97355 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SmsP97355 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
SmsP97355 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
SmsP97355 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SmsP97355 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SmsP97355 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SmsP97355 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SmsP97355 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SmsP97355 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SmsP97355 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SmsP97355 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SmsP97355 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SmsP97355 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
SmsP97355 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
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SmsP97355 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SmsP97355 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SmsP97355 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SmsP97355 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SmsP97355 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SmsP97355 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SmsP97355 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
SmsP97355 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SmsP97355 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
SmsP97355 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
SmsP97355 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
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SmsP97355 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SmsP97355 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SmsP97355 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SmsP97355 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SmsP97355 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SmsP97355 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SmsP97355 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SmsP97355 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SmsP97355 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
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SmsP97355 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SmsP97355 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
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SmsP97355 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SmsP97355 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
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SmsP97355 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
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SmsP97355 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SmsP97355 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SmsP97355 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
SmsP97355 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
SmsP97355 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
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