Protein–RNA interactions for Protein: P83917

Cbx1, Chromobox protein homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx1P83917 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cbx1P83917 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cbx1P83917 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cbx1P83917 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cbx1P83917 Btnl1-201ENSMUST00000080254 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cbx1P83917 Gm43522-201ENSMUST00000196697 1922 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Cbx1P83917 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cbx1P83917 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cbx1P83917 Ppp4r1-201ENSMUST00000073104 3850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cbx1P83917 Plin4-202ENSMUST00000190703 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cbx1P83917 Rapgef2-206ENSMUST00000195708 6964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cbx1P83917 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cbx1P83917 Tpx2-206ENSMUST00000164120 4365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cbx1P83917 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cbx1P83917 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cbx1P83917 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cbx1P83917 Exosc10-202ENSMUST00000076022 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cbx1P83917 Sass6-204ENSMUST00000197335 2458 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cbx1P83917 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Cbx1P83917 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cbx1P83917 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cbx1P83917 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cbx1P83917 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cbx1P83917 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cbx1P83917 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Cbx1P83917 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cbx1P83917 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cbx1P83917 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cbx1P83917 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cbx1P83917 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cbx1P83917 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cbx1P83917 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Cbx1P83917 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Cbx1P83917 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Cbx1P83917 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Cbx1P83917 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cbx1P83917 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Cbx1P83917 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cbx1P83917 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cbx1P83917 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cbx1P83917 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Cbx1P83917 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cbx1P83917 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Cbx1P83917 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cbx1P83917 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cbx1P83917 Tmem135-202ENSMUST00000117852 2986 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cbx1P83917 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cbx1P83917 Plekhg4-203ENSMUST00000160191 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cbx1P83917 Zswim9-203ENSMUST00000119558 3111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cbx1P83917 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cbx1P83917 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cbx1P83917 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cbx1P83917 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cbx1P83917 Gm45272-203ENSMUST00000211111 1693 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cbx1P83917 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cbx1P83917 Atp1a3-201ENSMUST00000080882 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cbx1P83917 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cbx1P83917 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cbx1P83917 Sema4a-201ENSMUST00000029700 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cbx1P83917 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cbx1P83917 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cbx1P83917 Rnf41-201ENSMUST00000096386 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cbx1P83917 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cbx1P83917 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cbx1P83917 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cbx1P83917 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Cbx1P83917 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cbx1P83917 Prok1-202ENSMUST00000197758 3063 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cbx1P83917 Tardbp-209ENSMUST00000165113 6495 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cbx1P83917 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cbx1P83917 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cbx1P83917 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cbx1P83917 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cbx1P83917 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cbx1P83917 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cbx1P83917 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Cbx1P83917 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cbx1P83917 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cbx1P83917 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Cbx1P83917 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cbx1P83917 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cbx1P83917 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Cbx1P83917 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Cbx1P83917 1700019D03Rik-201ENSMUST00000050567 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cbx1P83917 Tmem8b-209ENSMUST00000167153 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cbx1P83917 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cbx1P83917 Gm7642-201ENSMUST00000216345 1809 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Cbx1P83917 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cbx1P83917 Sord-201ENSMUST00000110551 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cbx1P83917 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cbx1P83917 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cbx1P83917 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cbx1P83917 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cbx1P83917 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cbx1P83917 Thoc5-201ENSMUST00000038237 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cbx1P83917 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cbx1P83917 Ppargc1b-201ENSMUST00000063307 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cbx1P83917 Fam53b-207ENSMUST00000106169 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cbx1P83917 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cbx1P83917 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms