Protein–RNA interactions for Protein: P81068

Irx1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx1P81068 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Irx1P81068 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Irx1P81068 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Irx1P81068 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Irx1P81068 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Irx1P81068 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Irx1P81068 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Irx1P81068 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Irx1P81068 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Irx1P81068 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Irx1P81068 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Irx1P81068 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Irx1P81068 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Irx1P81068 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Irx1P81068 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Irx1P81068 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Irx1P81068 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Irx1P81068 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Irx1P81068 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Irx1P81068 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Irx1P81068 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Irx1P81068 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Irx1P81068 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Irx1P81068 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Irx1P81068 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Irx1P81068 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Irx1P81068 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Irx1P81068 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Irx1P81068 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Irx1P81068 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Irx1P81068 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Irx1P81068 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Irx1P81068 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Irx1P81068 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Irx1P81068 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Irx1P81068 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Irx1P81068 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Irx1P81068 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Irx1P81068 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Irx1P81068 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Irx1P81068 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Irx1P81068 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Irx1P81068 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Irx1P81068 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Irx1P81068 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Irx1P81068 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Irx1P81068 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Irx1P81068 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Irx1P81068 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Irx1P81068 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Irx1P81068 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Irx1P81068 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Irx1P81068 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Irx1P81068 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Irx1P81068 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Irx1P81068 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Irx1P81068 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Irx1P81068 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Irx1P81068 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Irx1P81068 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Irx1P81068 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Irx1P81068 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Irx1P81068 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Irx1P81068 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Irx1P81068 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Irx1P81068 Tbc1d14-210ENSMUST00000140607 4649 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Irx1P81068 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Irx1P81068 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Irx1P81068 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Irx1P81068 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Irx1P81068 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Irx1P81068 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Irx1P81068 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Irx1P81068 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Irx1P81068 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Irx1P81068 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Irx1P81068 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Irx1P81068 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Irx1P81068 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Irx1P81068 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Irx1P81068 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Irx1P81068 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Irx1P81068 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Irx1P81068 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Irx1P81068 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Irx1P81068 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Irx1P81068 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Irx1P81068 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Irx1P81068 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Irx1P81068 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Irx1P81068 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Irx1P81068 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Irx1P81068 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Irx1P81068 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Irx1P81068 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Irx1P81068 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Irx1P81068 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Irx1P81068 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Irx1P81068 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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