Protein–RNA interactions for Protein: P81067

Irx3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx3P81067 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Irx3P81067 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Irx3P81067 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Irx3P81067 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Irx3P81067 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Irx3P81067 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Irx3P81067 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Irx3P81067 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Irx3P81067 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Irx3P81067 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Irx3P81067 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Irx3P81067 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Irx3P81067 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Irx3P81067 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Irx3P81067 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Irx3P81067 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Irx3P81067 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Irx3P81067 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Irx3P81067 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Irx3P81067 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Irx3P81067 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Irx3P81067 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Irx3P81067 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Irx3P81067 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Irx3P81067 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Irx3P81067 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Irx3P81067 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Irx3P81067 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Irx3P81067 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Irx3P81067 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Irx3P81067 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Irx3P81067 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Irx3P81067 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Irx3P81067 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Irx3P81067 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Irx3P81067 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Irx3P81067 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Irx3P81067 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Irx3P81067 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Irx3P81067 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Irx3P81067 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Irx3P81067 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Irx3P81067 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Irx3P81067 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Irx3P81067 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Irx3P81067 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Irx3P81067 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Irx3P81067 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Irx3P81067 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Irx3P81067 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Irx3P81067 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Irx3P81067 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Irx3P81067 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Irx3P81067 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Irx3P81067 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Irx3P81067 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Irx3P81067 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Irx3P81067 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Irx3P81067 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Irx3P81067 Gm15991-202ENSMUST00000212123 3565 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Irx3P81067 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Irx3P81067 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Irx3P81067 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Irx3P81067 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Irx3P81067 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Irx3P81067 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Irx3P81067 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Irx3P81067 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Irx3P81067 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Irx3P81067 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Irx3P81067 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Irx3P81067 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Irx3P81067 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Irx3P81067 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Irx3P81067 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Irx3P81067 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Irx3P81067 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Irx3P81067 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Irx3P81067 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Irx3P81067 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Irx3P81067 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Irx3P81067 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Irx3P81067 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Irx3P81067 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Irx3P81067 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Irx3P81067 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Irx3P81067 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Irx3P81067 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Irx3P81067 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Irx3P81067 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Irx3P81067 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Irx3P81067 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Irx3P81067 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Irx3P81067 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Irx3P81067 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Irx3P81067 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Irx3P81067 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Irx3P81067 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Irx3P81067 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Irx3P81067 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms