Protein–RNA interactions for Protein: P80206

Otx2, Homeobox protein OTX2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx2P80206 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Otx2P80206 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Otx2P80206 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Otx2P80206 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Otx2P80206 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Otx2P80206 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Otx2P80206 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Otx2P80206 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Otx2P80206 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Otx2P80206 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Otx2P80206 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Otx2P80206 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Otx2P80206 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Otx2P80206 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Otx2P80206 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Otx2P80206 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Otx2P80206 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Otx2P80206 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Otx2P80206 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Otx2P80206 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Otx2P80206 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Otx2P80206 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Otx2P80206 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Otx2P80206 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Otx2P80206 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Otx2P80206 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Otx2P80206 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Otx2P80206 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Otx2P80206 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Otx2P80206 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Otx2P80206 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Otx2P80206 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Otx2P80206 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Otx2P80206 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Otx2P80206 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Otx2P80206 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Otx2P80206 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Otx2P80206 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Otx2P80206 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Otx2P80206 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Otx2P80206 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Otx2P80206 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Otx2P80206 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Otx2P80206 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Otx2P80206 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Otx2P80206 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Otx2P80206 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Otx2P80206 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Otx2P80206 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Otx2P80206 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Otx2P80206 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Otx2P80206 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Otx2P80206 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Otx2P80206 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Otx2P80206 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Otx2P80206 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Otx2P80206 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Otx2P80206 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Otx2P80206 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Otx2P80206 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Otx2P80206 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Otx2P80206 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Otx2P80206 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Otx2P80206 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Otx2P80206 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Otx2P80206 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Otx2P80206 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Otx2P80206 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Otx2P80206 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Otx2P80206 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Otx2P80206 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Otx2P80206 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Otx2P80206 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Otx2P80206 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Otx2P80206 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Otx2P80206 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Otx2P80206 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Otx2P80206 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Otx2P80206 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Otx2P80206 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Otx2P80206 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Otx2P80206 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Otx2P80206 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Otx2P80206 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Otx2P80206 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Otx2P80206 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Otx2P80206 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Otx2P80206 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Otx2P80206 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Otx2P80206 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Otx2P80206 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Otx2P80206 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Otx2P80206 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Otx2P80206 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Otx2P80206 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Otx2P80206 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Otx2P80206 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Otx2P80206 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Otx2P80206 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Otx2P80206 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms