Protein–RNA interactions for Protein: P70232

Chl1, Neural cell adhesion molecule L1-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chl1P70232 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chl1P70232 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chl1P70232 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chl1P70232 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chl1P70232 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chl1P70232 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Chl1P70232 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chl1P70232 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chl1P70232 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chl1P70232 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chl1P70232 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Chl1P70232 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Chl1P70232 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chl1P70232 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chl1P70232 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chl1P70232 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chl1P70232 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chl1P70232 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chl1P70232 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chl1P70232 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chl1P70232 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chl1P70232 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chl1P70232 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chl1P70232 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chl1P70232 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chl1P70232 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chl1P70232 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chl1P70232 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chl1P70232 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chl1P70232 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chl1P70232 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chl1P70232 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chl1P70232 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chl1P70232 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chl1P70232 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chl1P70232 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chl1P70232 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chl1P70232 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chl1P70232 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chl1P70232 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chl1P70232 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chl1P70232 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chl1P70232 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Chl1P70232 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chl1P70232 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Chl1P70232 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Chl1P70232 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chl1P70232 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Chl1P70232 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Chl1P70232 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chl1P70232 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chl1P70232 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chl1P70232 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chl1P70232 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chl1P70232 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chl1P70232 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chl1P70232 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chl1P70232 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chl1P70232 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chl1P70232 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chl1P70232 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chl1P70232 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chl1P70232 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Chl1P70232 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chl1P70232 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chl1P70232 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chl1P70232 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chl1P70232 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chl1P70232 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chl1P70232 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chl1P70232 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chl1P70232 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chl1P70232 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Chl1P70232 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chl1P70232 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chl1P70232 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chl1P70232 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chl1P70232 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chl1P70232 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chl1P70232 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chl1P70232 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chl1P70232 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Chl1P70232 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chl1P70232 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chl1P70232 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Chl1P70232 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chl1P70232 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chl1P70232 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chl1P70232 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Chl1P70232 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chl1P70232 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chl1P70232 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chl1P70232 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chl1P70232 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chl1P70232 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chl1P70232 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chl1P70232 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chl1P70232 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chl1P70232 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chl1P70232 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58 ms