Protein–RNA interactions for Protein: P62960

Ybx1, Nuclease-sensitive element-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 322 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ybx1P62960 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ybx1P62960 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ybx1P62960 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ybx1P62960 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ybx1P62960 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ybx1P62960 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ybx1P62960 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ybx1P62960 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ybx1P62960 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ybx1P62960 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ybx1P62960 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ybx1P62960 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ybx1P62960 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ybx1P62960 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ybx1P62960 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ybx1P62960 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ybx1P62960 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ybx1P62960 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ybx1P62960 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ybx1P62960 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ybx1P62960 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ybx1P62960 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ybx1P62960 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ybx1P62960 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ybx1P62960 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ybx1P62960 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ybx1P62960 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ybx1P62960 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ybx1P62960 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ybx1P62960 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ybx1P62960 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ybx1P62960 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ybx1P62960 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ybx1P62960 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ybx1P62960 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ybx1P62960 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ybx1P62960 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ybx1P62960 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ybx1P62960 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ybx1P62960 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ybx1P62960 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ybx1P62960 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ybx1P62960 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ybx1P62960 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ybx1P62960 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ybx1P62960 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ybx1P62960 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ybx1P62960 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ybx1P62960 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ybx1P62960 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ybx1P62960 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ybx1P62960 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ybx1P62960 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ybx1P62960 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ybx1P62960 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ybx1P62960 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ybx1P62960 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ybx1P62960 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ybx1P62960 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ybx1P62960 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ybx1P62960 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ybx1P62960 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ybx1P62960 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ybx1P62960 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ybx1P62960 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ybx1P62960 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ybx1P62960 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ybx1P62960 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ybx1P62960 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ybx1P62960 AC154532.1-201ENSMUST00000227860 965 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ybx1P62960 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ybx1P62960 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ybx1P62960 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ybx1P62960 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ybx1P62960 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ybx1P62960 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ybx1P62960 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ybx1P62960 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ybx1P62960 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ybx1P62960 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ybx1P62960 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ybx1P62960 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ybx1P62960 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ybx1P62960 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ybx1P62960 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ybx1P62960 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ybx1P62960 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ybx1P62960 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ybx1P62960 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ybx1P62960 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ybx1P62960 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ybx1P62960 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ybx1P62960 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ybx1P62960 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ybx1P62960 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ybx1P62960 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ybx1P62960 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ybx1P62960 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ybx1P62960 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ybx1P62960 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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