Protein–RNA interactions for Protein: P61087

Ube2k, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 K, mousemouse

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Length 200 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2kP61087 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ube2kP61087 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ube2kP61087 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ube2kP61087 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ube2kP61087 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ube2kP61087 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ube2kP61087 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ube2kP61087 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ube2kP61087 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ube2kP61087 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ube2kP61087 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ube2kP61087 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ube2kP61087 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ube2kP61087 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ube2kP61087 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ube2kP61087 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ube2kP61087 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ube2kP61087 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ube2kP61087 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Ube2kP61087 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ube2kP61087 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ube2kP61087 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ube2kP61087 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ube2kP61087 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ube2kP61087 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ube2kP61087 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ube2kP61087 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ube2kP61087 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ube2kP61087 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ube2kP61087 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ube2kP61087 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ube2kP61087 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ube2kP61087 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Ube2kP61087 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ube2kP61087 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ube2kP61087 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ube2kP61087 Aff3-203ENSMUST00000095027 5857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ube2kP61087 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ube2kP61087 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ube2kP61087 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ube2kP61087 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ube2kP61087 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ube2kP61087 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ube2kP61087 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ube2kP61087 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ube2kP61087 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ube2kP61087 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ube2kP61087 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ube2kP61087 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ube2kP61087 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ube2kP61087 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ube2kP61087 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ube2kP61087 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ube2kP61087 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ube2kP61087 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ube2kP61087 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Ube2kP61087 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ube2kP61087 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ube2kP61087 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ube2kP61087 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ube2kP61087 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ube2kP61087 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Ube2kP61087 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Ube2kP61087 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Ube2kP61087 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Ube2kP61087 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ube2kP61087 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ube2kP61087 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Ube2kP61087 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ube2kP61087 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ube2kP61087 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ube2kP61087 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Ube2kP61087 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ube2kP61087 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ube2kP61087 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ube2kP61087 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ube2kP61087 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ube2kP61087 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ube2kP61087 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ube2kP61087 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ube2kP61087 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ube2kP61087 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ube2kP61087 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ube2kP61087 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ube2kP61087 Bod1l-204ENSMUST00000202908 10399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ube2kP61087 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ube2kP61087 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ube2kP61087 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Ube2kP61087 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ube2kP61087 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ube2kP61087 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ube2kP61087 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ube2kP61087 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ube2kP61087 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ube2kP61087 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ube2kP61087 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ube2kP61087 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ube2kP61087 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ube2kP61087 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ube2kP61087 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms