Protein–RNA interactions for Protein: P59240

Nphp4, Nephrocystin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp4P59240 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Nphp4P59240 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nphp4P59240 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nphp4P59240 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nphp4P59240 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nphp4P59240 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nphp4P59240 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nphp4P59240 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nphp4P59240 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nphp4P59240 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nphp4P59240 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nphp4P59240 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nphp4P59240 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nphp4P59240 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nphp4P59240 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nphp4P59240 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nphp4P59240 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nphp4P59240 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nphp4P59240 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nphp4P59240 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nphp4P59240 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nphp4P59240 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Nphp4P59240 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Nphp4P59240 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nphp4P59240 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nphp4P59240 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Nphp4P59240 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nphp4P59240 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nphp4P59240 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nphp4P59240 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nphp4P59240 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nphp4P59240 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nphp4P59240 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nphp4P59240 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nphp4P59240 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nphp4P59240 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nphp4P59240 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nphp4P59240 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nphp4P59240 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Nphp4P59240 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nphp4P59240 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nphp4P59240 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nphp4P59240 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nphp4P59240 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nphp4P59240 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nphp4P59240 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nphp4P59240 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Nphp4P59240 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Nphp4P59240 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nphp4P59240 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Nphp4P59240 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Nphp4P59240 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Nphp4P59240 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nphp4P59240 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Nphp4P59240 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nphp4P59240 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Nphp4P59240 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nphp4P59240 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nphp4P59240 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nphp4P59240 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nphp4P59240 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nphp4P59240 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nphp4P59240 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nphp4P59240 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nphp4P59240 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nphp4P59240 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nphp4P59240 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nphp4P59240 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nphp4P59240 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nphp4P59240 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nphp4P59240 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nphp4P59240 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nphp4P59240 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nphp4P59240 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nphp4P59240 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nphp4P59240 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nphp4P59240 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nphp4P59240 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nphp4P59240 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nphp4P59240 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nphp4P59240 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nphp4P59240 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nphp4P59240 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nphp4P59240 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nphp4P59240 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nphp4P59240 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Nphp4P59240 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nphp4P59240 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nphp4P59240 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nphp4P59240 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nphp4P59240 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nphp4P59240 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nphp4P59240 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nphp4P59240 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nphp4P59240 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nphp4P59240 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nphp4P59240 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Nphp4P59240 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nphp4P59240 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nphp4P59240 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms