Protein–RNA interactions for Protein: P58854

Tubgcp3, Gamma-tubulin complex component 3, mousemouse

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Length 905 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubgcp3P58854 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tubgcp3P58854 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tubgcp3P58854 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tubgcp3P58854 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tubgcp3P58854 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tubgcp3P58854 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tubgcp3P58854 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tubgcp3P58854 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tubgcp3P58854 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Tubgcp3P58854 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Tubgcp3P58854 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tubgcp3P58854 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Tubgcp3P58854 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tubgcp3P58854 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Tubgcp3P58854 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tubgcp3P58854 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Tubgcp3P58854 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tubgcp3P58854 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Tubgcp3P58854 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tubgcp3P58854 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tubgcp3P58854 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tubgcp3P58854 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tubgcp3P58854 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tubgcp3P58854 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tubgcp3P58854 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tubgcp3P58854 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tubgcp3P58854 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tubgcp3P58854 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tubgcp3P58854 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tubgcp3P58854 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tubgcp3P58854 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tubgcp3P58854 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tubgcp3P58854 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tubgcp3P58854 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tubgcp3P58854 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tubgcp3P58854 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tubgcp3P58854 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tubgcp3P58854 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tubgcp3P58854 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tubgcp3P58854 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tubgcp3P58854 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tubgcp3P58854 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tubgcp3P58854 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tubgcp3P58854 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tubgcp3P58854 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tubgcp3P58854 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tubgcp3P58854 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tubgcp3P58854 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tubgcp3P58854 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tubgcp3P58854 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tubgcp3P58854 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tubgcp3P58854 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tubgcp3P58854 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tubgcp3P58854 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tubgcp3P58854 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tubgcp3P58854 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tubgcp3P58854 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Tubgcp3P58854 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tubgcp3P58854 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tubgcp3P58854 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Tubgcp3P58854 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Tubgcp3P58854 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tubgcp3P58854 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tubgcp3P58854 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tubgcp3P58854 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tubgcp3P58854 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tubgcp3P58854 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tubgcp3P58854 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tubgcp3P58854 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tubgcp3P58854 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tubgcp3P58854 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tubgcp3P58854 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Tubgcp3P58854 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tubgcp3P58854 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tubgcp3P58854 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tubgcp3P58854 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tubgcp3P58854 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tubgcp3P58854 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Tubgcp3P58854 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Tubgcp3P58854 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Tubgcp3P58854 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Tubgcp3P58854 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Tubgcp3P58854 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Tubgcp3P58854 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tubgcp3P58854 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tubgcp3P58854 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tubgcp3P58854 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tubgcp3P58854 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tubgcp3P58854 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tubgcp3P58854 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tubgcp3P58854 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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