Protein–RNA interactions for Protein: P57748

Mmp20, Matrix metalloproteinase-20, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp20P57748 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Mmp20P57748 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Mmp20P57748 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Mmp20P57748 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Mmp20P57748 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mmp20P57748 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Mmp20P57748 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mmp20P57748 Gm18556-201ENSMUST00000219748 1031 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Mmp20P57748 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mmp20P57748 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mmp20P57748 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mmp20P57748 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mmp20P57748 Fam92b-201ENSMUST00000048786 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mmp20P57748 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mmp20P57748 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mmp20P57748 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mmp20P57748 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mmp20P57748 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mmp20P57748 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mmp20P57748 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mmp20P57748 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mmp20P57748 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mmp20P57748 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mmp20P57748 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mmp20P57748 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mmp20P57748 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mmp20P57748 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mmp20P57748 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mmp20P57748 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mmp20P57748 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mmp20P57748 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mmp20P57748 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mmp20P57748 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mmp20P57748 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mmp20P57748 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mmp20P57748 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mmp20P57748 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mmp20P57748 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mmp20P57748 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mmp20P57748 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mmp20P57748 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mmp20P57748 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mmp20P57748 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mmp20P57748 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mmp20P57748 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Mmp20P57748 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mmp20P57748 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mmp20P57748 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Mmp20P57748 Gm10109-202ENSMUST00000206890 1211 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Mmp20P57748 C230062I16Rik-204ENSMUST00000208342 643 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mmp20P57748 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Mmp20P57748 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Mmp20P57748 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mmp20P57748 mt-Rnr1-201ENSMUST00000082388 955 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Mmp20P57748 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mmp20P57748 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mmp20P57748 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Mmp20P57748 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mmp20P57748 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mmp20P57748 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mmp20P57748 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mmp20P57748 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mmp20P57748 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mmp20P57748 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mmp20P57748 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mmp20P57748 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mmp20P57748 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mmp20P57748 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mmp20P57748 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mmp20P57748 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mmp20P57748 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mmp20P57748 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mmp20P57748 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Mmp20P57748 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Mmp20P57748 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Mmp20P57748 Gm42791-202ENSMUST00000147473 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mmp20P57748 Gm9550-201ENSMUST00000161130 862 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Mmp20P57748 Gm9211-201ENSMUST00000182882 975 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Mmp20P57748 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mmp20P57748 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mmp20P57748 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Mmp20P57748 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mmp20P57748 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mmp20P57748 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mmp20P57748 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mmp20P57748 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mmp20P57748 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mmp20P57748 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mmp20P57748 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mmp20P57748 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mmp20P57748 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mmp20P57748 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Mmp20P57748 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mmp20P57748 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mmp20P57748 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mmp20P57748 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mmp20P57748 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mmp20P57748 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mmp20P57748 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mmp20P57748 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms