Protein–RNA interactions for Protein: P57080

Usp25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, mousemouse

Predictions only

Length 1,055 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp25P57080 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp25P57080 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp25P57080 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp25P57080 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp25P57080 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp25P57080 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp25P57080 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp25P57080 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp25P57080 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp25P57080 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp25P57080 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp25P57080 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp25P57080 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp25P57080 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp25P57080 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp25P57080 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp25P57080 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp25P57080 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp25P57080 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp25P57080 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp25P57080 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp25P57080 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp25P57080 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp25P57080 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp25P57080 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp25P57080 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp25P57080 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp25P57080 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp25P57080 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp25P57080 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp25P57080 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp25P57080 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp25P57080 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp25P57080 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp25P57080 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp25P57080 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp25P57080 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp25P57080 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp25P57080 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp25P57080 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp25P57080 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp25P57080 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp25P57080 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp25P57080 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp25P57080 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp25P57080 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp25P57080 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp25P57080 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp25P57080 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp25P57080 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp25P57080 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp25P57080 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp25P57080 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp25P57080 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp25P57080 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp25P57080 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp25P57080 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp25P57080 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp25P57080 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp25P57080 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp25P57080 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp25P57080 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp25P57080 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp25P57080 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp25P57080 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp25P57080 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp25P57080 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp25P57080 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp25P57080 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp25P57080 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp25P57080 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp25P57080 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp25P57080 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp25P57080 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp25P57080 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp25P57080 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp25P57080 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp25P57080 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp25P57080 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp25P57080 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp25P57080 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp25P57080 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp25P57080 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp25P57080 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp25P57080 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp25P57080 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp25P57080 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp25P57080 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp25P57080 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp25P57080 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp25P57080 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp25P57080 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp25P57080 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp25P57080 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp25P57080 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp25P57080 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp25P57080 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp25P57080 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp25P57080 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp25P57080 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms