Protein–RNA interactions for Protein: P56857

Cldn18, Claudin-18, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn18P56857 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
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Cldn18P56857 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn18P56857 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn18P56857 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn18P56857 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn18P56857 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn18P56857 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
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Cldn18P56857 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn18P56857 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn18P56857 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn18P56857 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn18P56857 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn18P56857 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn18P56857 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn18P56857 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn18P56857 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn18P56857 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
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Cldn18P56857 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn18P56857 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
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Cldn18P56857 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn18P56857 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn18P56857 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
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Cldn18P56857 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn18P56857 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn18P56857 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn18P56857 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn18P56857 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
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Cldn18P56857 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
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Cldn18P56857 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn18P56857 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
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Cldn18P56857 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn18P56857 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn18P56857 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn18P56857 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn18P56857 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn18P56857 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
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Cldn18P56857 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn18P56857 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn18P56857 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn18P56857 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn18P56857 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn18P56857 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
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Cldn18P56857 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn18P56857 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn18P56857 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn18P56857 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn18P56857 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn18P56857 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn18P56857 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn18P56857 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn18P56857 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn18P56857 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn18P56857 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn18P56857 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn18P56857 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn18P56857 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn18P56857 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn18P56857 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn18P56857 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn18P56857 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn18P56857 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn18P56857 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
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