Protein–RNA interactions for Protein: P56480

Atp5b, ATP synthase subunit beta, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp5bP56480 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Atp5bP56480 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Atp5bP56480 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Atp5bP56480 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Atp5bP56480 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Atp5bP56480 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Atp5bP56480 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Atp5bP56480 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Atp5bP56480 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Atp5bP56480 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Atp5bP56480 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Atp5bP56480 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Atp5bP56480 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Atp5bP56480 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Atp5bP56480 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Atp5bP56480 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Atp5bP56480 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Atp5bP56480 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Atp5bP56480 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Atp5bP56480 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Atp5bP56480 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Atp5bP56480 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Atp5bP56480 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Atp5bP56480 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Atp5bP56480 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Atp5bP56480 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Atp5bP56480 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Atp5bP56480 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Atp5bP56480 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Atp5bP56480 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Atp5bP56480 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Atp5bP56480 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Atp5bP56480 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Atp5bP56480 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Atp5bP56480 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Atp5bP56480 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Atp5bP56480 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Atp5bP56480 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Atp5bP56480 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Atp5bP56480 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Atp5bP56480 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Atp5bP56480 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Atp5bP56480 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Atp5bP56480 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Atp5bP56480 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Atp5bP56480 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Atp5bP56480 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Atp5bP56480 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Atp5bP56480 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Atp5bP56480 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Atp5bP56480 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Atp5bP56480 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Atp5bP56480 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Atp5bP56480 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Atp5bP56480 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Atp5bP56480 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Atp5bP56480 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Atp5bP56480 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Atp5bP56480 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Atp5bP56480 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Atp5bP56480 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Atp5bP56480 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Atp5bP56480 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Atp5bP56480 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Atp5bP56480 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Atp5bP56480 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Atp5bP56480 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Atp5bP56480 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Atp5bP56480 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Atp5bP56480 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Atp5bP56480 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Atp5bP56480 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Atp5bP56480 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Atp5bP56480 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Atp5bP56480 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Atp5bP56480 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Atp5bP56480 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Atp5bP56480 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Atp5bP56480 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Atp5bP56480 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Atp5bP56480 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Atp5bP56480 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Atp5bP56480 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Atp5bP56480 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Atp5bP56480 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Atp5bP56480 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Atp5bP56480 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Atp5bP56480 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Atp5bP56480 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Atp5bP56480 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Atp5bP56480 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Atp5bP56480 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Atp5bP56480 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Atp5bP56480 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Atp5bP56480 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Atp5bP56480 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Atp5bP56480 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Atp5bP56480 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Atp5bP56480 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Atp5bP56480 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms