Protein–RNA interactions for Protein: P53808

Pctp, Phosphatidylcholine transfer protein, mousemouse

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PctpP53808 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
PctpP53808 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PctpP53808 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
PctpP53808 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PctpP53808 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
PctpP53808 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PctpP53808 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PctpP53808 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PctpP53808 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PctpP53808 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
PctpP53808 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
PctpP53808 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PctpP53808 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PctpP53808 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PctpP53808 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PctpP53808 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
PctpP53808 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
PctpP53808 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
PctpP53808 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
PctpP53808 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
PctpP53808 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PctpP53808 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
PctpP53808 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PctpP53808 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
PctpP53808 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PctpP53808 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PctpP53808 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
PctpP53808 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PctpP53808 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PctpP53808 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PctpP53808 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
PctpP53808 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PctpP53808 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PctpP53808 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PctpP53808 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PctpP53808 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PctpP53808 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PctpP53808 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PctpP53808 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PctpP53808 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PctpP53808 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PctpP53808 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
PctpP53808 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
PctpP53808 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
PctpP53808 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
PctpP53808 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PctpP53808 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PctpP53808 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PctpP53808 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PctpP53808 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
PctpP53808 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
PctpP53808 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PctpP53808 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
PctpP53808 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PctpP53808 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
PctpP53808 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PctpP53808 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PctpP53808 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PctpP53808 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PctpP53808 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PctpP53808 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
PctpP53808 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
PctpP53808 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PctpP53808 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PctpP53808 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PctpP53808 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PctpP53808 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
PctpP53808 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PctpP53808 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PctpP53808 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PctpP53808 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PctpP53808 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PctpP53808 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PctpP53808 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
PctpP53808 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PctpP53808 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PctpP53808 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PctpP53808 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
PctpP53808 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PctpP53808 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PctpP53808 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
PctpP53808 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
PctpP53808 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PctpP53808 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
PctpP53808 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
PctpP53808 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PctpP53808 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PctpP53808 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
PctpP53808 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
PctpP53808 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PctpP53808 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
PctpP53808 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
PctpP53808 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
PctpP53808 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
PctpP53808 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PctpP53808 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
PctpP53808 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PctpP53808 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
PctpP53808 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PctpP53808 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.9 ms