Protein–RNA interactions for Protein: P47758

Srprb, Signal recognition particle receptor subunit beta, mousemouse

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Length 269 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrprbP47758 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SrprbP47758 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SrprbP47758 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SrprbP47758 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SrprbP47758 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SrprbP47758 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SrprbP47758 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SrprbP47758 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SrprbP47758 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SrprbP47758 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SrprbP47758 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SrprbP47758 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SrprbP47758 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SrprbP47758 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SrprbP47758 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SrprbP47758 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SrprbP47758 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SrprbP47758 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SrprbP47758 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SrprbP47758 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SrprbP47758 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SrprbP47758 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SrprbP47758 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SrprbP47758 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SrprbP47758 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SrprbP47758 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SrprbP47758 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SrprbP47758 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SrprbP47758 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SrprbP47758 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SrprbP47758 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SrprbP47758 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SrprbP47758 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SrprbP47758 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SrprbP47758 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SrprbP47758 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SrprbP47758 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SrprbP47758 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SrprbP47758 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SrprbP47758 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SrprbP47758 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SrprbP47758 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SrprbP47758 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SrprbP47758 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SrprbP47758 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SrprbP47758 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SrprbP47758 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
SrprbP47758 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
SrprbP47758 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
SrprbP47758 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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SrprbP47758 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SrprbP47758 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SrprbP47758 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SrprbP47758 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SrprbP47758 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SrprbP47758 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SrprbP47758 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SrprbP47758 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SrprbP47758 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SrprbP47758 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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SrprbP47758 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SrprbP47758 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SrprbP47758 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SrprbP47758 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SrprbP47758 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SrprbP47758 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SrprbP47758 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SrprbP47758 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SrprbP47758 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SrprbP47758 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SrprbP47758 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SrprbP47758 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SrprbP47758 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SrprbP47758 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SrprbP47758 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SrprbP47758 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
SrprbP47758 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
SrprbP47758 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SrprbP47758 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SrprbP47758 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SrprbP47758 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SrprbP47758 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SrprbP47758 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SrprbP47758 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SrprbP47758 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SrprbP47758 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SrprbP47758 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SrprbP47758 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SrprbP47758 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
SrprbP47758 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
SrprbP47758 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SrprbP47758 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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SrprbP47758 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SrprbP47758 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SrprbP47758 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SrprbP47758 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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