Protein–RNA interactions for Protein: P46414

Cdkn1b, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1B, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn1bP46414 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cdkn1bP46414 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cdkn1bP46414 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cdkn1bP46414 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cdkn1bP46414 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cdkn1bP46414 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cdkn1bP46414 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cdkn1bP46414 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cdkn1bP46414 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cdkn1bP46414 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cdkn1bP46414 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cdkn1bP46414 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cdkn1bP46414 Sgk1-213ENSMUST00000164659 2602 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cdkn1bP46414 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cdkn1bP46414 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cdkn1bP46414 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cdkn1bP46414 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Cdkn1bP46414 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cdkn1bP46414 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Cdkn1bP46414 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cdkn1bP46414 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cdkn1bP46414 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cdkn1bP46414 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cdkn1bP46414 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Cdkn1bP46414 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Cdkn1bP46414 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cdkn1bP46414 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Cdkn1bP46414 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cdkn1bP46414 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cdkn1bP46414 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cdkn1bP46414 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cdkn1bP46414 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cdkn1bP46414 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cdkn1bP46414 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cdkn1bP46414 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Cdkn1bP46414 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cdkn1bP46414 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cdkn1bP46414 Gm15987-201ENSMUST00000141700 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cdkn1bP46414 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cdkn1bP46414 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cdkn1bP46414 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cdkn1bP46414 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cdkn1bP46414 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cdkn1bP46414 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cdkn1bP46414 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cdkn1bP46414 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Cdkn1bP46414 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cdkn1bP46414 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cdkn1bP46414 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cdkn1bP46414 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cdkn1bP46414 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cdkn1bP46414 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cdkn1bP46414 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cdkn1bP46414 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cdkn1bP46414 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cdkn1bP46414 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cdkn1bP46414 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cdkn1bP46414 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cdkn1bP46414 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cdkn1bP46414 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Cdkn1bP46414 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cdkn1bP46414 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cdkn1bP46414 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cdkn1bP46414 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cdkn1bP46414 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cdkn1bP46414 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cdkn1bP46414 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cdkn1bP46414 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cdkn1bP46414 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cdkn1bP46414 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cdkn1bP46414 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cdkn1bP46414 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cdkn1bP46414 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cdkn1bP46414 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cdkn1bP46414 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cdkn1bP46414 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cdkn1bP46414 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Cdkn1bP46414 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Cdkn1bP46414 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cdkn1bP46414 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cdkn1bP46414 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cdkn1bP46414 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cdkn1bP46414 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Cdkn1bP46414 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cdkn1bP46414 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cdkn1bP46414 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cdkn1bP46414 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cdkn1bP46414 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cdkn1bP46414 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cdkn1bP46414 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Cdkn1bP46414 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cdkn1bP46414 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cdkn1bP46414 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cdkn1bP46414 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cdkn1bP46414 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cdkn1bP46414 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cdkn1bP46414 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cdkn1bP46414 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cdkn1bP46414 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cdkn1bP46414 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms